Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
KLHL12Q53G59 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KLHL12Q53G59 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL12Q53G59 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL12Q53G59 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL12Q53G59 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL12Q53G59 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL12Q53G59 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL12Q53G59 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL12Q53G59 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL12Q53G59 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL12Q53G59 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL12Q53G59 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL12Q53G59 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL12Q53G59 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL12Q53G59 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL12Q53G59 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL12Q53G59 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL12Q53G59 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL12Q53G59 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL12Q53G59 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL12Q53G59 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL12Q53G59 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL12Q53G59 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL12Q53G59 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL12Q53G59 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL12Q53G59 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL12Q53G59 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL12Q53G59 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL12Q53G59 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL12Q53G59 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL12Q53G59 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL12Q53G59 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL12Q53G59 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL12Q53G59 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL12Q53G59 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL12Q53G59 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL12Q53G59 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL12Q53G59 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL12Q53G59 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL12Q53G59 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL12Q53G59 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL12Q53G59 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL12Q53G59 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL12Q53G59 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL12Q53G59 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL12Q53G59 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL12Q53G59 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL12Q53G59 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL12Q53G59 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL12Q53G59 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL12Q53G59 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL12Q53G59 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL12Q53G59 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL12Q53G59 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL12Q53G59 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL12Q53G59 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL12Q53G59 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL12Q53G59 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL12Q53G59 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL12Q53G59 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL12Q53G59 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL12Q53G59 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL12Q53G59 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL12Q53G59 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL12Q53G59 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL12Q53G59 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL12Q53G59 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL12Q53G59 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL12Q53G59 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL12Q53G59 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL12Q53G59 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL12Q53G59 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL12Q53G59 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL12Q53G59 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL12Q53G59 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL12Q53G59 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL12Q53G59 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL12Q53G59 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL12Q53G59 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL12Q53G59 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL12Q53G59 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL12Q53G59 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL12Q53G59 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL12Q53G59 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL12Q53G59 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL12Q53G59 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL12Q53G59 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL12Q53G59 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL12Q53G59 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL12Q53G59 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL12Q53G59 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL12Q53G59 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL12Q53G59 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL12Q53G59 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL12Q53G59 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL12Q53G59 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL12Q53G59 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL12Q53G59 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL12Q53G59 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms