Protein–RNA interactions for Protein: Q499Z3

SLFNL1, Schlafen-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFNL1Q499Z3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLFNL1Q499Z3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLFNL1Q499Z3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLFNL1Q499Z3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLFNL1Q499Z3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLFNL1Q499Z3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLFNL1Q499Z3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLFNL1Q499Z3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLFNL1Q499Z3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLFNL1Q499Z3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SLFNL1Q499Z3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLFNL1Q499Z3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLFNL1Q499Z3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLFNL1Q499Z3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLFNL1Q499Z3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLFNL1Q499Z3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLFNL1Q499Z3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLFNL1Q499Z3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLFNL1Q499Z3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLFNL1Q499Z3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SLFNL1Q499Z3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLFNL1Q499Z3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLFNL1Q499Z3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLFNL1Q499Z3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLFNL1Q499Z3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SLFNL1Q499Z3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLFNL1Q499Z3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLFNL1Q499Z3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SLFNL1Q499Z3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLFNL1Q499Z3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLFNL1Q499Z3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLFNL1Q499Z3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLFNL1Q499Z3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLFNL1Q499Z3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLFNL1Q499Z3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLFNL1Q499Z3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLFNL1Q499Z3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
SLFNL1Q499Z3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLFNL1Q499Z3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLFNL1Q499Z3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLFNL1Q499Z3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLFNL1Q499Z3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLFNL1Q499Z3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLFNL1Q499Z3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLFNL1Q499Z3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLFNL1Q499Z3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLFNL1Q499Z3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLFNL1Q499Z3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLFNL1Q499Z3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLFNL1Q499Z3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLFNL1Q499Z3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLFNL1Q499Z3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLFNL1Q499Z3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLFNL1Q499Z3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLFNL1Q499Z3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLFNL1Q499Z3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLFNL1Q499Z3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLFNL1Q499Z3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLFNL1Q499Z3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLFNL1Q499Z3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLFNL1Q499Z3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLFNL1Q499Z3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SLFNL1Q499Z3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SLFNL1Q499Z3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SLFNL1Q499Z3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SLFNL1Q499Z3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SLFNL1Q499Z3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLFNL1Q499Z3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLFNL1Q499Z3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLFNL1Q499Z3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
SLFNL1Q499Z3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLFNL1Q499Z3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLFNL1Q499Z3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLFNL1Q499Z3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLFNL1Q499Z3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLFNL1Q499Z3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SLFNL1Q499Z3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SLFNL1Q499Z3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLFNL1Q499Z3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLFNL1Q499Z3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLFNL1Q499Z3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLFNL1Q499Z3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLFNL1Q499Z3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SLFNL1Q499Z3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLFNL1Q499Z3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SLFNL1Q499Z3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLFNL1Q499Z3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLFNL1Q499Z3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLFNL1Q499Z3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLFNL1Q499Z3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLFNL1Q499Z3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLFNL1Q499Z3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLFNL1Q499Z3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLFNL1Q499Z3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLFNL1Q499Z3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLFNL1Q499Z3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLFNL1Q499Z3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLFNL1Q499Z3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLFNL1Q499Z3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLFNL1Q499Z3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.3 ms