Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD55Q3KP44 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD55Q3KP44 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD55Q3KP44 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD55Q3KP44 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD55Q3KP44 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD55Q3KP44 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD55Q3KP44 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD55Q3KP44 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD55Q3KP44 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD55Q3KP44 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD55Q3KP44 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD55Q3KP44 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD55Q3KP44 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD55Q3KP44 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD55Q3KP44 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD55Q3KP44 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD55Q3KP44 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD55Q3KP44 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD55Q3KP44 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD55Q3KP44 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ANKRD55Q3KP44 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ANKRD55Q3KP44 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ANKRD55Q3KP44 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ANKRD55Q3KP44 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD55Q3KP44 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD55Q3KP44 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD55Q3KP44 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD55Q3KP44 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD55Q3KP44 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD55Q3KP44 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD55Q3KP44 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD55Q3KP44 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD55Q3KP44 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD55Q3KP44 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD55Q3KP44 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD55Q3KP44 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD55Q3KP44 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD55Q3KP44 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD55Q3KP44 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD55Q3KP44 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD55Q3KP44 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD55Q3KP44 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD55Q3KP44 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD55Q3KP44 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD55Q3KP44 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD55Q3KP44 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD55Q3KP44 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD55Q3KP44 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD55Q3KP44 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD55Q3KP44 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD55Q3KP44 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD55Q3KP44 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD55Q3KP44 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD55Q3KP44 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD55Q3KP44 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD55Q3KP44 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD55Q3KP44 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD55Q3KP44 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD55Q3KP44 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD55Q3KP44 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD55Q3KP44 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD55Q3KP44 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD55Q3KP44 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD55Q3KP44 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD55Q3KP44 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD55Q3KP44 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD55Q3KP44 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD55Q3KP44 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD55Q3KP44 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD55Q3KP44 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD55Q3KP44 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD55Q3KP44 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD55Q3KP44 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD55Q3KP44 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD55Q3KP44 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD55Q3KP44 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD55Q3KP44 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD55Q3KP44 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD55Q3KP44 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD55Q3KP44 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD55Q3KP44 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD55Q3KP44 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD55Q3KP44 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD55Q3KP44 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD55Q3KP44 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD55Q3KP44 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD55Q3KP44 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD55Q3KP44 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ANKRD55Q3KP44 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ANKRD55Q3KP44 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ANKRD55Q3KP44 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ANKRD55Q3KP44 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ANKRD55Q3KP44 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ANKRD55Q3KP44 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ANKRD55Q3KP44 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ANKRD55Q3KP44 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
ANKRD55Q3KP44 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ANKRD55Q3KP44 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ANKRD55Q3KP44 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms