Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHL38Q2WGJ6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHL38Q2WGJ6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHL38Q2WGJ6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHL38Q2WGJ6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHL38Q2WGJ6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHL38Q2WGJ6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHL38Q2WGJ6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHL38Q2WGJ6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHL38Q2WGJ6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHL38Q2WGJ6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHL38Q2WGJ6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHL38Q2WGJ6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHL38Q2WGJ6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHL38Q2WGJ6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHL38Q2WGJ6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHL38Q2WGJ6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHL38Q2WGJ6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHL38Q2WGJ6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL38Q2WGJ6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL38Q2WGJ6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL38Q2WGJ6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL38Q2WGJ6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL38Q2WGJ6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL38Q2WGJ6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL38Q2WGJ6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL38Q2WGJ6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL38Q2WGJ6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL38Q2WGJ6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL38Q2WGJ6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL38Q2WGJ6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KLHL38Q2WGJ6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KLHL38Q2WGJ6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KLHL38Q2WGJ6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KLHL38Q2WGJ6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KLHL38Q2WGJ6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLHL38Q2WGJ6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLHL38Q2WGJ6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLHL38Q2WGJ6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHL38Q2WGJ6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHL38Q2WGJ6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHL38Q2WGJ6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHL38Q2WGJ6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHL38Q2WGJ6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHL38Q2WGJ6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHL38Q2WGJ6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHL38Q2WGJ6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHL38Q2WGJ6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHL38Q2WGJ6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL38Q2WGJ6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL38Q2WGJ6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL38Q2WGJ6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL38Q2WGJ6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL38Q2WGJ6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL38Q2WGJ6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL38Q2WGJ6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHL38Q2WGJ6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHL38Q2WGJ6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHL38Q2WGJ6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHL38Q2WGJ6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHL38Q2WGJ6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHL38Q2WGJ6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHL38Q2WGJ6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHL38Q2WGJ6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHL38Q2WGJ6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHL38Q2WGJ6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHL38Q2WGJ6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHL38Q2WGJ6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHL38Q2WGJ6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHL38Q2WGJ6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHL38Q2WGJ6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHL38Q2WGJ6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHL38Q2WGJ6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL38Q2WGJ6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL38Q2WGJ6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL38Q2WGJ6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL38Q2WGJ6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL38Q2WGJ6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL38Q2WGJ6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL38Q2WGJ6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL38Q2WGJ6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL38Q2WGJ6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL38Q2WGJ6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL38Q2WGJ6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL38Q2WGJ6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL38Q2WGJ6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL38Q2WGJ6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL38Q2WGJ6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL38Q2WGJ6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL38Q2WGJ6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL38Q2WGJ6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
KLHL38Q2WGJ6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
KLHL38Q2WGJ6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHL38Q2WGJ6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHL38Q2WGJ6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHL38Q2WGJ6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHL38Q2WGJ6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHL38Q2WGJ6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHL38Q2WGJ6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHL38Q2WGJ6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms