Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM71Q2Q1W2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM71Q2Q1W2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM71Q2Q1W2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM71Q2Q1W2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM71Q2Q1W2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM71Q2Q1W2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM71Q2Q1W2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM71Q2Q1W2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM71Q2Q1W2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM71Q2Q1W2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM71Q2Q1W2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM71Q2Q1W2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM71Q2Q1W2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM71Q2Q1W2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM71Q2Q1W2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM71Q2Q1W2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM71Q2Q1W2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM71Q2Q1W2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM71Q2Q1W2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM71Q2Q1W2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM71Q2Q1W2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM71Q2Q1W2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM71Q2Q1W2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM71Q2Q1W2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM71Q2Q1W2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM71Q2Q1W2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM71Q2Q1W2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM71Q2Q1W2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM71Q2Q1W2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM71Q2Q1W2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM71Q2Q1W2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM71Q2Q1W2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM71Q2Q1W2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM71Q2Q1W2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM71Q2Q1W2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM71Q2Q1W2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM71Q2Q1W2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM71Q2Q1W2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM71Q2Q1W2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM71Q2Q1W2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM71Q2Q1W2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM71Q2Q1W2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM71Q2Q1W2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM71Q2Q1W2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM71Q2Q1W2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM71Q2Q1W2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM71Q2Q1W2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM71Q2Q1W2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM71Q2Q1W2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM71Q2Q1W2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM71Q2Q1W2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM71Q2Q1W2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM71Q2Q1W2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM71Q2Q1W2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM71Q2Q1W2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM71Q2Q1W2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM71Q2Q1W2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM71Q2Q1W2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM71Q2Q1W2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM71Q2Q1W2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM71Q2Q1W2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM71Q2Q1W2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM71Q2Q1W2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM71Q2Q1W2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM71Q2Q1W2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM71Q2Q1W2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM71Q2Q1W2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM71Q2Q1W2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM71Q2Q1W2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM71Q2Q1W2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM71Q2Q1W2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM71Q2Q1W2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM71Q2Q1W2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM71Q2Q1W2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM71Q2Q1W2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM71Q2Q1W2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM71Q2Q1W2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM71Q2Q1W2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM71Q2Q1W2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM71Q2Q1W2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM71Q2Q1W2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM71Q2Q1W2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM71Q2Q1W2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM71Q2Q1W2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM71Q2Q1W2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM71Q2Q1W2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM71Q2Q1W2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM71Q2Q1W2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM71Q2Q1W2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM71Q2Q1W2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM71Q2Q1W2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TRIM71Q2Q1W2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM71Q2Q1W2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM71Q2Q1W2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM71Q2Q1W2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM71Q2Q1W2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM71Q2Q1W2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM71Q2Q1W2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM71Q2Q1W2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms