Protein–RNA interactions for Protein: Q16526

CRY1, Cryptochrome-1, humanhuman

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Length 586 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY1Q16526 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRY1Q16526 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRY1Q16526 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRY1Q16526 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRY1Q16526 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRY1Q16526 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRY1Q16526 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRY1Q16526 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRY1Q16526 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRY1Q16526 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRY1Q16526 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRY1Q16526 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRY1Q16526 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CRY1Q16526 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CRY1Q16526 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRY1Q16526 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRY1Q16526 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRY1Q16526 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRY1Q16526 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRY1Q16526 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRY1Q16526 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRY1Q16526 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRY1Q16526 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRY1Q16526 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRY1Q16526 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRY1Q16526 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRY1Q16526 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRY1Q16526 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRY1Q16526 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRY1Q16526 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRY1Q16526 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRY1Q16526 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRY1Q16526 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRY1Q16526 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRY1Q16526 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRY1Q16526 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRY1Q16526 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CRY1Q16526 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CRY1Q16526 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CRY1Q16526 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CRY1Q16526 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CRY1Q16526 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CRY1Q16526 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CRY1Q16526 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRY1Q16526 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRY1Q16526 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRY1Q16526 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRY1Q16526 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRY1Q16526 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRY1Q16526 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRY1Q16526 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CRY1Q16526 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRY1Q16526 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRY1Q16526 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRY1Q16526 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRY1Q16526 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRY1Q16526 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRY1Q16526 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRY1Q16526 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRY1Q16526 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRY1Q16526 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRY1Q16526 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRY1Q16526 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CRY1Q16526 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRY1Q16526 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRY1Q16526 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRY1Q16526 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRY1Q16526 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRY1Q16526 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRY1Q16526 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRY1Q16526 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRY1Q16526 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRY1Q16526 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CRY1Q16526 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CRY1Q16526 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CRY1Q16526 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CRY1Q16526 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRY1Q16526 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRY1Q16526 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRY1Q16526 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRY1Q16526 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRY1Q16526 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRY1Q16526 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRY1Q16526 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRY1Q16526 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRY1Q16526 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRY1Q16526 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRY1Q16526 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CRY1Q16526 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRY1Q16526 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRY1Q16526 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRY1Q16526 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRY1Q16526 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRY1Q16526 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRY1Q16526 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRY1Q16526 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRY1Q16526 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRY1Q16526 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRY1Q16526 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRY1Q16526 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
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