Protein–RNA interactions for Protein: Q15907

RAB11B, Ras-related protein Rab-11B, humanhuman

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11BQ15907 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
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RAB11BQ15907 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB11BQ15907 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB11BQ15907 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB11BQ15907 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB11BQ15907 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB11BQ15907 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB11BQ15907 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB11BQ15907 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB11BQ15907 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB11BQ15907 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB11BQ15907 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB11BQ15907 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB11BQ15907 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB11BQ15907 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB11BQ15907 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB11BQ15907 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB11BQ15907 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB11BQ15907 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB11BQ15907 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB11BQ15907 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB11BQ15907 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB11BQ15907 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB11BQ15907 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB11BQ15907 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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RAB11BQ15907 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB11BQ15907 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB11BQ15907 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB11BQ15907 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB11BQ15907 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB11BQ15907 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB11BQ15907 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB11BQ15907 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
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RAB11BQ15907 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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RAB11BQ15907 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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RAB11BQ15907 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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RAB11BQ15907 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB11BQ15907 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB11BQ15907 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB11BQ15907 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB11BQ15907 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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RAB11BQ15907 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB11BQ15907 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
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RAB11BQ15907 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB11BQ15907 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB11BQ15907 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB11BQ15907 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB11BQ15907 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB11BQ15907 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB11BQ15907 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB11BQ15907 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB11BQ15907 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB11BQ15907 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB11BQ15907 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB11BQ15907 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB11BQ15907 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB11BQ15907 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB11BQ15907 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB11BQ15907 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
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