Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CNN3Q15417 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CNN3Q15417 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CNN3Q15417 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CNN3Q15417 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CNN3Q15417 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CNN3Q15417 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CNN3Q15417 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CNN3Q15417 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CNN3Q15417 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CNN3Q15417 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CNN3Q15417 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CNN3Q15417 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CNN3Q15417 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CNN3Q15417 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CNN3Q15417 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CNN3Q15417 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CNN3Q15417 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CNN3Q15417 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CNN3Q15417 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CNN3Q15417 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CNN3Q15417 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CNN3Q15417 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CNN3Q15417 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CNN3Q15417 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CNN3Q15417 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CNN3Q15417 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CNN3Q15417 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CNN3Q15417 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CNN3Q15417 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CNN3Q15417 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CNN3Q15417 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CNN3Q15417 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CNN3Q15417 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CNN3Q15417 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CNN3Q15417 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CNN3Q15417 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CNN3Q15417 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CNN3Q15417 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CNN3Q15417 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CNN3Q15417 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CNN3Q15417 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CNN3Q15417 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CNN3Q15417 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CNN3Q15417 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CNN3Q15417 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CNN3Q15417 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CNN3Q15417 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CNN3Q15417 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNN3Q15417 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNN3Q15417 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNN3Q15417 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNN3Q15417 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNN3Q15417 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNN3Q15417 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNN3Q15417 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNN3Q15417 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNN3Q15417 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNN3Q15417 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CNN3Q15417 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNN3Q15417 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNN3Q15417 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNN3Q15417 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNN3Q15417 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNN3Q15417 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNN3Q15417 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNN3Q15417 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNN3Q15417 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CNN3Q15417 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNN3Q15417 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNN3Q15417 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNN3Q15417 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNN3Q15417 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNN3Q15417 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNN3Q15417 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNN3Q15417 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNN3Q15417 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNN3Q15417 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNN3Q15417 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNN3Q15417 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNN3Q15417 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNN3Q15417 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNN3Q15417 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNN3Q15417 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CNN3Q15417 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNN3Q15417 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNN3Q15417 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNN3Q15417 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNN3Q15417 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNN3Q15417 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNN3Q15417 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNN3Q15417 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNN3Q15417 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNN3Q15417 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNN3Q15417 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNN3Q15417 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNN3Q15417 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNN3Q15417 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNN3Q15417 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNN3Q15417 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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