Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

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Length 2,024 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCM1Q15154 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCM1Q15154 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCM1Q15154 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCM1Q15154 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PCM1Q15154 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCM1Q15154 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCM1Q15154 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCM1Q15154 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCM1Q15154 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCM1Q15154 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCM1Q15154 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCM1Q15154 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCM1Q15154 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCM1Q15154 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCM1Q15154 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCM1Q15154 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCM1Q15154 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PCM1Q15154 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCM1Q15154 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCM1Q15154 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCM1Q15154 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCM1Q15154 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCM1Q15154 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PCM1Q15154 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCM1Q15154 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCM1Q15154 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCM1Q15154 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCM1Q15154 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCM1Q15154 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCM1Q15154 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PCM1Q15154 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCM1Q15154 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCM1Q15154 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCM1Q15154 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCM1Q15154 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCM1Q15154 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCM1Q15154 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCM1Q15154 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCM1Q15154 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCM1Q15154 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PCM1Q15154 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PCM1Q15154 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCM1Q15154 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCM1Q15154 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PCM1Q15154 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCM1Q15154 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCM1Q15154 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCM1Q15154 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCM1Q15154 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCM1Q15154 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCM1Q15154 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCM1Q15154 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCM1Q15154 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCM1Q15154 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCM1Q15154 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCM1Q15154 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCM1Q15154 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCM1Q15154 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCM1Q15154 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCM1Q15154 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCM1Q15154 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCM1Q15154 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCM1Q15154 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCM1Q15154 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCM1Q15154 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCM1Q15154 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCM1Q15154 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCM1Q15154 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCM1Q15154 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCM1Q15154 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCM1Q15154 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCM1Q15154 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCM1Q15154 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCM1Q15154 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCM1Q15154 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCM1Q15154 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCM1Q15154 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCM1Q15154 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCM1Q15154 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCM1Q15154 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCM1Q15154 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCM1Q15154 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCM1Q15154 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCM1Q15154 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCM1Q15154 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCM1Q15154 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCM1Q15154 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCM1Q15154 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCM1Q15154 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCM1Q15154 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCM1Q15154 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PCM1Q15154 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PCM1Q15154 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCM1Q15154 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCM1Q15154 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PCM1Q15154 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCM1Q15154 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCM1Q15154 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCM1Q15154 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
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