Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HERC3Q15034 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HERC3Q15034 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HERC3Q15034 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HERC3Q15034 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HERC3Q15034 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HERC3Q15034 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HERC3Q15034 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HERC3Q15034 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HERC3Q15034 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HERC3Q15034 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HERC3Q15034 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HERC3Q15034 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HERC3Q15034 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HERC3Q15034 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HERC3Q15034 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HERC3Q15034 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HERC3Q15034 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HERC3Q15034 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HERC3Q15034 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HERC3Q15034 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HERC3Q15034 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HERC3Q15034 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HERC3Q15034 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HERC3Q15034 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HERC3Q15034 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HERC3Q15034 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HERC3Q15034 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HERC3Q15034 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HERC3Q15034 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HERC3Q15034 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HERC3Q15034 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HERC3Q15034 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HERC3Q15034 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HERC3Q15034 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HERC3Q15034 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HERC3Q15034 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HERC3Q15034 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HERC3Q15034 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HERC3Q15034 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HERC3Q15034 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HERC3Q15034 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HERC3Q15034 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HERC3Q15034 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HERC3Q15034 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HERC3Q15034 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HERC3Q15034 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HERC3Q15034 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HERC3Q15034 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HERC3Q15034 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HERC3Q15034 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HERC3Q15034 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HERC3Q15034 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HERC3Q15034 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HERC3Q15034 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HERC3Q15034 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HERC3Q15034 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HERC3Q15034 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HERC3Q15034 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HERC3Q15034 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HERC3Q15034 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HERC3Q15034 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HERC3Q15034 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HERC3Q15034 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HERC3Q15034 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HERC3Q15034 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HERC3Q15034 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HERC3Q15034 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HERC3Q15034 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HERC3Q15034 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HERC3Q15034 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HERC3Q15034 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HERC3Q15034 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HERC3Q15034 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HERC3Q15034 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HERC3Q15034 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HERC3Q15034 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HERC3Q15034 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HERC3Q15034 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HERC3Q15034 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HERC3Q15034 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HERC3Q15034 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HERC3Q15034 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HERC3Q15034 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HERC3Q15034 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HERC3Q15034 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HERC3Q15034 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HERC3Q15034 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HERC3Q15034 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HERC3Q15034 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HERC3Q15034 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HERC3Q15034 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HERC3Q15034 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HERC3Q15034 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HERC3Q15034 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HERC3Q15034 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HERC3Q15034 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HERC3Q15034 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HERC3Q15034 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HERC3Q15034 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
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