Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.59■■■■□ 3.93
GAPVD1Q14C86 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
GAPVD1Q14C86 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC39.58■■■■□ 3.93
GAPVD1Q14C86 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.58■■■■□ 3.93
GAPVD1Q14C86 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC39.57■■■■□ 3.93
GAPVD1Q14C86 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
GAPVD1Q14C86 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
GAPVD1Q14C86 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
GAPVD1Q14C86 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
GAPVD1Q14C86 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC39.56■■■■□ 3.92
GAPVD1Q14C86 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
GAPVD1Q14C86 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.56■■■■□ 3.92
GAPVD1Q14C86 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
GAPVD1Q14C86 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.55■■■■□ 3.92
GAPVD1Q14C86 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC39.54■■■■□ 3.92
GAPVD1Q14C86 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC39.53■■■■□ 3.92
GAPVD1Q14C86 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
GAPVD1Q14C86 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
GAPVD1Q14C86 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.52■■■■□ 3.92
GAPVD1Q14C86 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC39.52■■■■□ 3.92
GAPVD1Q14C86 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC39.51■■■■□ 3.92
GAPVD1Q14C86 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC39.51■■■■□ 3.92
GAPVD1Q14C86 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC39.51■■■■□ 3.92
GAPVD1Q14C86 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC39.51■■■■□ 3.92
GAPVD1Q14C86 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.91
GAPVD1Q14C86 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.5■■■■□ 3.91
GAPVD1Q14C86 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.5■■■■□ 3.91
GAPVD1Q14C86 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
GAPVD1Q14C86 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
GAPVD1Q14C86 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC39.49■■■■□ 3.91
GAPVD1Q14C86 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
GAPVD1Q14C86 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
GAPVD1Q14C86 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC39.49■■■■□ 3.91
GAPVD1Q14C86 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
GAPVD1Q14C86 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC39.48■■■■□ 3.91
GAPVD1Q14C86 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
GAPVD1Q14C86 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC39.47■■■■□ 3.91
GAPVD1Q14C86 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
GAPVD1Q14C86 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
GAPVD1Q14C86 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC39.45■■■■□ 3.91
GAPVD1Q14C86 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
GAPVD1Q14C86 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
GAPVD1Q14C86 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
GAPVD1Q14C86 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.44■■■■□ 3.9
GAPVD1Q14C86 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.44■■■■□ 3.9
GAPVD1Q14C86 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC39.43■■■■□ 3.9
GAPVD1Q14C86 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
GAPVD1Q14C86 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
GAPVD1Q14C86 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.43■■■■□ 3.9
GAPVD1Q14C86 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.43■■■■□ 3.9
GAPVD1Q14C86 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC39.43■■■■□ 3.9
GAPVD1Q14C86 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.42■■■■□ 3.9
GAPVD1Q14C86 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC39.42■■■■□ 3.9
GAPVD1Q14C86 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC39.42■■■■□ 3.9
GAPVD1Q14C86 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC39.42■■■■□ 3.9
GAPVD1Q14C86 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
GAPVD1Q14C86 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
GAPVD1Q14C86 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC39.4■■■■□ 3.9
GAPVD1Q14C86 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC39.4■■■■□ 3.9
GAPVD1Q14C86 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC39.4■■■■□ 3.9
GAPVD1Q14C86 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC39.4■■■■□ 3.9
GAPVD1Q14C86 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
GAPVD1Q14C86 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
GAPVD1Q14C86 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC39.39■■■■□ 3.9
GAPVD1Q14C86 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC39.39■■■■□ 3.9
GAPVD1Q14C86 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.9
GAPVD1Q14C86 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC39.38■■■■□ 3.9
GAPVD1Q14C86 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC39.38■■■■□ 3.9
GAPVD1Q14C86 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC39.38■■■■□ 3.9
GAPVD1Q14C86 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.38■■■■□ 3.89
GAPVD1Q14C86 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
GAPVD1Q14C86 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
GAPVD1Q14C86 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC39.37■■■■□ 3.89
GAPVD1Q14C86 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
GAPVD1Q14C86 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC39.37■■■■□ 3.89
GAPVD1Q14C86 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC39.36■■■■□ 3.89
GAPVD1Q14C86 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
GAPVD1Q14C86 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
GAPVD1Q14C86 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.36■■■■□ 3.89
GAPVD1Q14C86 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
GAPVD1Q14C86 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC39.35■■■■□ 3.89
GAPVD1Q14C86 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC39.34■■■■□ 3.89
GAPVD1Q14C86 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
GAPVD1Q14C86 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
GAPVD1Q14C86 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
GAPVD1Q14C86 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC39.33■■■■□ 3.89
GAPVD1Q14C86 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
GAPVD1Q14C86 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
GAPVD1Q14C86 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC39.31■■■■□ 3.88
GAPVD1Q14C86 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.31■■■■□ 3.88
GAPVD1Q14C86 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC39.31■■■■□ 3.88
GAPVD1Q14C86 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC39.31■■■■□ 3.88
GAPVD1Q14C86 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
GAPVD1Q14C86 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.31■■■■□ 3.88
GAPVD1Q14C86 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
GAPVD1Q14C86 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
GAPVD1Q14C86 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
GAPVD1Q14C86 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC39.3■■■■□ 3.88
GAPVD1Q14C86 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
GAPVD1Q14C86 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
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