Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP1A4Q13733 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP1A4Q13733 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP1A4Q13733 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP1A4Q13733 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP1A4Q13733 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP1A4Q13733 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP1A4Q13733 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP1A4Q13733 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP1A4Q13733 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP1A4Q13733 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP1A4Q13733 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP1A4Q13733 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP1A4Q13733 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP1A4Q13733 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP1A4Q13733 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP1A4Q13733 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP1A4Q13733 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP1A4Q13733 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP1A4Q13733 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP1A4Q13733 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP1A4Q13733 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP1A4Q13733 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP1A4Q13733 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP1A4Q13733 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP1A4Q13733 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP1A4Q13733 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP1A4Q13733 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP1A4Q13733 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP1A4Q13733 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP1A4Q13733 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP1A4Q13733 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP1A4Q13733 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP1A4Q13733 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP1A4Q13733 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP1A4Q13733 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP1A4Q13733 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATP1A4Q13733 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATP1A4Q13733 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP1A4Q13733 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP1A4Q13733 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP1A4Q13733 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP1A4Q13733 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP1A4Q13733 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP1A4Q13733 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP1A4Q13733 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP1A4Q13733 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP1A4Q13733 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP1A4Q13733 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP1A4Q13733 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP1A4Q13733 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP1A4Q13733 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP1A4Q13733 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP1A4Q13733 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP1A4Q13733 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP1A4Q13733 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP1A4Q13733 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP1A4Q13733 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP1A4Q13733 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP1A4Q13733 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP1A4Q13733 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP1A4Q13733 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP1A4Q13733 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP1A4Q13733 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP1A4Q13733 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP1A4Q13733 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP1A4Q13733 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP1A4Q13733 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP1A4Q13733 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP1A4Q13733 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP1A4Q13733 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP1A4Q13733 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP1A4Q13733 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP1A4Q13733 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP1A4Q13733 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP1A4Q13733 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP1A4Q13733 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP1A4Q13733 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP1A4Q13733 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP1A4Q13733 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP1A4Q13733 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP1A4Q13733 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP1A4Q13733 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP1A4Q13733 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP1A4Q13733 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP1A4Q13733 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP1A4Q13733 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP1A4Q13733 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP1A4Q13733 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP1A4Q13733 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP1A4Q13733 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP1A4Q13733 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP1A4Q13733 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP1A4Q13733 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP1A4Q13733 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP1A4Q13733 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP1A4Q13733 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP1A4Q13733 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP1A4Q13733 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP1A4Q13733 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
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