Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C1orf61Q13536 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C1orf61Q13536 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C1orf61Q13536 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C1orf61Q13536 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C1orf61Q13536 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C1orf61Q13536 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C1orf61Q13536 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C1orf61Q13536 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C1orf61Q13536 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C1orf61Q13536 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C1orf61Q13536 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C1orf61Q13536 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C1orf61Q13536 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C1orf61Q13536 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C1orf61Q13536 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C1orf61Q13536 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C1orf61Q13536 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C1orf61Q13536 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C1orf61Q13536 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C1orf61Q13536 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
C1orf61Q13536 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1orf61Q13536 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1orf61Q13536 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1orf61Q13536 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1orf61Q13536 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1orf61Q13536 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1orf61Q13536 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
C1orf61Q13536 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1orf61Q13536 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
C1orf61Q13536 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
C1orf61Q13536 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
C1orf61Q13536 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
C1orf61Q13536 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
C1orf61Q13536 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C1orf61Q13536 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C1orf61Q13536 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C1orf61Q13536 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C1orf61Q13536 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C1orf61Q13536 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C1orf61Q13536 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C1orf61Q13536 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
C1orf61Q13536 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C1orf61Q13536 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C1orf61Q13536 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C1orf61Q13536 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C1orf61Q13536 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
C1orf61Q13536 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C1orf61Q13536 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C1orf61Q13536 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C1orf61Q13536 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C1orf61Q13536 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C1orf61Q13536 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C1orf61Q13536 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C1orf61Q13536 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1orf61Q13536 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1orf61Q13536 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1orf61Q13536 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1orf61Q13536 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1orf61Q13536 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C1orf61Q13536 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
C1orf61Q13536 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C1orf61Q13536 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C1orf61Q13536 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C1orf61Q13536 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C1orf61Q13536 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C1orf61Q13536 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C1orf61Q13536 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C1orf61Q13536 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C1orf61Q13536 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C1orf61Q13536 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C1orf61Q13536 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C1orf61Q13536 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C1orf61Q13536 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C1orf61Q13536 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C1orf61Q13536 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C1orf61Q13536 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C1orf61Q13536 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
C1orf61Q13536 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C1orf61Q13536 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
C1orf61Q13536 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
C1orf61Q13536 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C1orf61Q13536 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C1orf61Q13536 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C1orf61Q13536 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C1orf61Q13536 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C1orf61Q13536 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
C1orf61Q13536 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C1orf61Q13536 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C1orf61Q13536 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C1orf61Q13536 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C1orf61Q13536 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C1orf61Q13536 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C1orf61Q13536 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C1orf61Q13536 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C1orf61Q13536 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C1orf61Q13536 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
C1orf61Q13536 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C1orf61Q13536 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C1orf61Q13536 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
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