Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHAF1AQ13111 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHAF1AQ13111 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHAF1AQ13111 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CHAF1AQ13111 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CHAF1AQ13111 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CHAF1AQ13111 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CHAF1AQ13111 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CHAF1AQ13111 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CHAF1AQ13111 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CHAF1AQ13111 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CHAF1AQ13111 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CHAF1AQ13111 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CHAF1AQ13111 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CHAF1AQ13111 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CHAF1AQ13111 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CHAF1AQ13111 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHAF1AQ13111 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHAF1AQ13111 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHAF1AQ13111 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHAF1AQ13111 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHAF1AQ13111 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHAF1AQ13111 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CHAF1AQ13111 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CHAF1AQ13111 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CHAF1AQ13111 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CHAF1AQ13111 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CHAF1AQ13111 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CHAF1AQ13111 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CHAF1AQ13111 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CHAF1AQ13111 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CHAF1AQ13111 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CHAF1AQ13111 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CHAF1AQ13111 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CHAF1AQ13111 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CHAF1AQ13111 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CHAF1AQ13111 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CHAF1AQ13111 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CHAF1AQ13111 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CHAF1AQ13111 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHAF1AQ13111 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHAF1AQ13111 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHAF1AQ13111 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHAF1AQ13111 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHAF1AQ13111 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHAF1AQ13111 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHAF1AQ13111 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHAF1AQ13111 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CHAF1AQ13111 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CHAF1AQ13111 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CHAF1AQ13111 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CHAF1AQ13111 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CHAF1AQ13111 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CHAF1AQ13111 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CHAF1AQ13111 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CHAF1AQ13111 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CHAF1AQ13111 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CHAF1AQ13111 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CHAF1AQ13111 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CHAF1AQ13111 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CHAF1AQ13111 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CHAF1AQ13111 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CHAF1AQ13111 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CHAF1AQ13111 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CHAF1AQ13111 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CHAF1AQ13111 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CHAF1AQ13111 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CHAF1AQ13111 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CHAF1AQ13111 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CHAF1AQ13111 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CHAF1AQ13111 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CHAF1AQ13111 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CHAF1AQ13111 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CHAF1AQ13111 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CHAF1AQ13111 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CHAF1AQ13111 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CHAF1AQ13111 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CHAF1AQ13111 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CHAF1AQ13111 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CHAF1AQ13111 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CHAF1AQ13111 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CHAF1AQ13111 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CHAF1AQ13111 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CHAF1AQ13111 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CHAF1AQ13111 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CHAF1AQ13111 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CHAF1AQ13111 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CHAF1AQ13111 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CHAF1AQ13111 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CHAF1AQ13111 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CHAF1AQ13111 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CHAF1AQ13111 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CHAF1AQ13111 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CHAF1AQ13111 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CHAF1AQ13111 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CHAF1AQ13111 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CHAF1AQ13111 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHAF1AQ13111 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHAF1AQ13111 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHAF1AQ13111 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.8 ms