Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIK2Q13002 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIK2Q13002 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRIK2Q13002 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRIK2Q13002 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRIK2Q13002 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRIK2Q13002 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRIK2Q13002 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIK2Q13002 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIK2Q13002 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIK2Q13002 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIK2Q13002 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIK2Q13002 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIK2Q13002 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIK2Q13002 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIK2Q13002 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIK2Q13002 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIK2Q13002 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIK2Q13002 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIK2Q13002 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRIK2Q13002 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRIK2Q13002 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRIK2Q13002 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRIK2Q13002 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRIK2Q13002 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIK2Q13002 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIK2Q13002 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIK2Q13002 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIK2Q13002 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIK2Q13002 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIK2Q13002 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIK2Q13002 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIK2Q13002 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIK2Q13002 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIK2Q13002 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIK2Q13002 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIK2Q13002 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIK2Q13002 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIK2Q13002 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIK2Q13002 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIK2Q13002 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIK2Q13002 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIK2Q13002 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIK2Q13002 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIK2Q13002 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIK2Q13002 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIK2Q13002 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIK2Q13002 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIK2Q13002 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIK2Q13002 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIK2Q13002 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIK2Q13002 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIK2Q13002 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIK2Q13002 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIK2Q13002 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIK2Q13002 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIK2Q13002 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIK2Q13002 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIK2Q13002 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIK2Q13002 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIK2Q13002 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIK2Q13002 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GRIK2Q13002 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GRIK2Q13002 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
GRIK2Q13002 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
GRIK2Q13002 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRIK2Q13002 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRIK2Q13002 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRIK2Q13002 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIK2Q13002 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIK2Q13002 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIK2Q13002 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIK2Q13002 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIK2Q13002 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIK2Q13002 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIK2Q13002 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIK2Q13002 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIK2Q13002 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIK2Q13002 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIK2Q13002 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIK2Q13002 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIK2Q13002 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIK2Q13002 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIK2Q13002 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIK2Q13002 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIK2Q13002 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIK2Q13002 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIK2Q13002 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIK2Q13002 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIK2Q13002 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIK2Q13002 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIK2Q13002 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIK2Q13002 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIK2Q13002 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIK2Q13002 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIK2Q13002 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIK2Q13002 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIK2Q13002 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIK2Q13002 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIK2Q13002 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
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