Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BNIP3Q12983 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BNIP3Q12983 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BNIP3Q12983 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BNIP3Q12983 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BNIP3Q12983 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BNIP3Q12983 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BNIP3Q12983 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BNIP3Q12983 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BNIP3Q12983 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BNIP3Q12983 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BNIP3Q12983 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BNIP3Q12983 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BNIP3Q12983 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BNIP3Q12983 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
BNIP3Q12983 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BNIP3Q12983 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BNIP3Q12983 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BNIP3Q12983 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BNIP3Q12983 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BNIP3Q12983 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BNIP3Q12983 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BNIP3Q12983 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BNIP3Q12983 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BNIP3Q12983 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BNIP3Q12983 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
BNIP3Q12983 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
BNIP3Q12983 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
BNIP3Q12983 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BNIP3Q12983 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BNIP3Q12983 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BNIP3Q12983 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BNIP3Q12983 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
BNIP3Q12983 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BNIP3Q12983 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BNIP3Q12983 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BNIP3Q12983 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BNIP3Q12983 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BNIP3Q12983 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
BNIP3Q12983 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
BNIP3Q12983 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BNIP3Q12983 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BNIP3Q12983 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BNIP3Q12983 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BNIP3Q12983 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BNIP3Q12983 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BNIP3Q12983 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BNIP3Q12983 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BNIP3Q12983 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BNIP3Q12983 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BNIP3Q12983 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BNIP3Q12983 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BNIP3Q12983 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BNIP3Q12983 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
BNIP3Q12983 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BNIP3Q12983 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BNIP3Q12983 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BNIP3Q12983 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BNIP3Q12983 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BNIP3Q12983 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BNIP3Q12983 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BNIP3Q12983 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BNIP3Q12983 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BNIP3Q12983 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BNIP3Q12983 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BNIP3Q12983 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BNIP3Q12983 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BNIP3Q12983 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BNIP3Q12983 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BNIP3Q12983 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BNIP3Q12983 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BNIP3Q12983 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BNIP3Q12983 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BNIP3Q12983 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BNIP3Q12983 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BNIP3Q12983 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BNIP3Q12983 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BNIP3Q12983 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BNIP3Q12983 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BNIP3Q12983 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BNIP3Q12983 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BNIP3Q12983 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BNIP3Q12983 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BNIP3Q12983 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BNIP3Q12983 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BNIP3Q12983 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BNIP3Q12983 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BNIP3Q12983 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BNIP3Q12983 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BNIP3Q12983 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BNIP3Q12983 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
BNIP3Q12983 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BNIP3Q12983 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BNIP3Q12983 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BNIP3Q12983 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BNIP3Q12983 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BNIP3Q12983 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BNIP3Q12983 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BNIP3Q12983 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BNIP3Q12983 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms