Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TWF1Q12792 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TWF1Q12792 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TWF1Q12792 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TWF1Q12792 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TWF1Q12792 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TWF1Q12792 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TWF1Q12792 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TWF1Q12792 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TWF1Q12792 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TWF1Q12792 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TWF1Q12792 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TWF1Q12792 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TWF1Q12792 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TWF1Q12792 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TWF1Q12792 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TWF1Q12792 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TWF1Q12792 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TWF1Q12792 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TWF1Q12792 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TWF1Q12792 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TWF1Q12792 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TWF1Q12792 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TWF1Q12792 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TWF1Q12792 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TWF1Q12792 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TWF1Q12792 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TWF1Q12792 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TWF1Q12792 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TWF1Q12792 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TWF1Q12792 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TWF1Q12792 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TWF1Q12792 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
TWF1Q12792 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TWF1Q12792 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TWF1Q12792 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TWF1Q12792 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TWF1Q12792 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TWF1Q12792 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TWF1Q12792 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TWF1Q12792 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TWF1Q12792 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TWF1Q12792 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TWF1Q12792 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TWF1Q12792 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TWF1Q12792 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TWF1Q12792 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TWF1Q12792 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TWF1Q12792 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TWF1Q12792 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TWF1Q12792 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TWF1Q12792 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TWF1Q12792 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TWF1Q12792 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TWF1Q12792 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TWF1Q12792 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TWF1Q12792 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TWF1Q12792 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TWF1Q12792 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TWF1Q12792 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TWF1Q12792 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TWF1Q12792 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TWF1Q12792 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TWF1Q12792 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TWF1Q12792 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TWF1Q12792 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TWF1Q12792 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TWF1Q12792 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TWF1Q12792 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TWF1Q12792 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TWF1Q12792 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TWF1Q12792 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TWF1Q12792 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TWF1Q12792 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TWF1Q12792 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TWF1Q12792 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TWF1Q12792 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TWF1Q12792 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TWF1Q12792 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TWF1Q12792 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TWF1Q12792 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TWF1Q12792 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TWF1Q12792 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TWF1Q12792 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TWF1Q12792 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TWF1Q12792 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TWF1Q12792 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TWF1Q12792 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TWF1Q12792 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TWF1Q12792 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TWF1Q12792 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TWF1Q12792 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TWF1Q12792 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TWF1Q12792 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TWF1Q12792 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TWF1Q12792 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TWF1Q12792 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TWF1Q12792 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TWF1Q12792 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TWF1Q12792 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
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