Protein–RNA interactions for Protein: Q12391

TY1A-NL1, Transposon Ty1-NL1 Gag polyprotein, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-NL1Q12391 MRL1YPR079W 1146 nt6.49□□□□□ -1.37
TY1A-NL1Q12391 MHP1YJL042W 4197 nt6.49□□□□□ -1.37
TY1A-NL1Q12391 BPL1YDL141W 2073 nt6.49□□□□□ -1.37
TY1A-NL1Q12391 SKP1YDR328C 585 nt6.48□□□□□ -1.37
TY1A-NL1Q12391 SUF3tG(CCC)D 72 nt6.48□□□□□ -1.37
TY1A-NL1Q12391 CIR1YGR207C 786 nt6.48□□□□□ -1.37
TY1A-NL1Q12391 STS1YIR011C 960 nt6.48□□□□□ -1.37
TY1A-NL1Q12391 HRT3YLR097C 1035 nt6.48□□□□□ -1.37
TY1A-NL1Q12391 SMD3YLR147C 306 nt6.48□□□□□ -1.37
TY1A-NL1Q12391 IMD1YAR073W 1212 nt6.48□□□□□ -1.37
TY1A-NL1Q12391 MTF1YMR228W 1026 nt6.48□□□□□ -1.37
TY1A-NL1Q12391 RFC4YOL094C 972 nt6.48□□□□□ -1.37
TY1A-NL1Q12391 SLG1YOR008C 1137 nt6.48□□□□□ -1.37
TY1A-NL1Q12391 MED4YOR174W 855 nt6.48□□□□□ -1.37
TY1A-NL1Q12391 PHO85YPL031C 918 nt6.48□□□□□ -1.37
TY1A-NL1Q12391 CUP9YPL177C 921 nt6.48□□□□□ -1.37
TY1A-NL1Q12391 YPR147CYPR147C 915 nt6.48□□□□□ -1.37
TY1A-NL1Q12391 MTF2YDL044C 1323 nt6.48□□□□□ -1.37
TY1A-NL1Q12391 YOR389WYOR389W 1875 nt6.47□□□□□ -1.37
TY1A-NL1Q12391 CRP1YHR146W 1398 nt6.47□□□□□ -1.37
TY1A-NL1Q12391 SKI8YGL213C 1194 nt6.47□□□□□ -1.37
TY1A-NL1Q12391 RCN1YKL159C 636 nt6.47□□□□□ -1.37
TY1A-NL1Q12391 RUF22RUF22 515 nt6.47□□□□□ -1.37
TY1A-NL1Q12391 YOL035CYOL035C 303 nt6.47□□□□□ -1.37
TY1A-NL1Q12391 YPL162CYPL162C 822 nt6.47□□□□□ -1.37
TY1A-NL1Q12391 ATP20YPR020W 348 nt6.47□□□□□ -1.37
TY1A-NL1Q12391 SNT309YPR101W 528 nt6.47□□□□□ -1.37
TY1A-NL1Q12391 RRT2YBR246W 1164 nt6.47□□□□□ -1.37
TY1A-NL1Q12391 SRO9YCL037C 1305 nt6.47□□□□□ -1.37
TY1A-NL1Q12391 OSM1YJR051W 1506 nt6.46□□□□□ -1.37
TY1A-NL1Q12391 NHP10YDL002C 612 nt6.46□□□□□ -1.38
TY1A-NL1Q12391 PPH21YDL134C 1110 nt6.46□□□□□ -1.38
TY1A-NL1Q12391 EBP2YKL172W 1284 nt6.46□□□□□ -1.38
TY1A-NL1Q12391 SPC2YML055W 537 nt6.46□□□□□ -1.38
TY1A-NL1Q12391 YPR109WYPR109W 885 nt6.46□□□□□ -1.38
TY1A-NL1Q12391 CLN2YPL256C 1638 nt6.46□□□□□ -1.38
TY1A-NL1Q12391 CDC13YDL220C 2775 nt6.46□□□□□ -1.38
TY1A-NL1Q12391 PRP19YLL036C 1512 nt6.45□□□□□ -1.38
TY1A-NL1Q12391 MCH2YKL221W 1422 nt6.45□□□□□ -1.38
TY1A-NL1Q12391 TRR1YDR353W 960 nt6.45□□□□□ -1.38
TY1A-NL1Q12391 ACT1YFL039C 1128 nt6.45□□□□□ -1.38
TY1A-NL1Q12391 IRC7YFR055W 1023 nt6.45□□□□□ -1.38
TY1A-NL1Q12391 MTR3YGR158C 753 nt6.45□□□□□ -1.38
TY1A-NL1Q12391 YLR225CYLR225C 1224 nt6.45□□□□□ -1.38
TY1A-NL1Q12391 PUP1YOR157C 786 nt6.45□□□□□ -1.38
TY1A-NL1Q12391 RQC1YDR333C 2172 nt6.45□□□□□ -1.38
TY1A-NL1Q12391 CYB2YML054C 1776 nt6.44□□□□□ -1.38
TY1A-NL1Q12391 TDP1YBR223C 1635 nt6.44□□□□□ -1.38
TY1A-NL1Q12391 IRC22YEL001C 678 nt6.44□□□□□ -1.38
TY1A-NL1Q12391 PRE1YER012W 597 nt6.44□□□□□ -1.38
TY1A-NL1Q12391 NVJ1YHR195W 966 nt6.44□□□□□ -1.38
TY1A-NL1Q12391 TAD2YJL035C 753 nt6.44□□□□□ -1.38
TY1A-NL1Q12391 CCW12YLR110C 402 nt6.44□□□□□ -1.38
TY1A-NL1Q12391 CAF40YNL288W 1122 nt6.44□□□□□ -1.38
TY1A-NL1Q12391 ROX3YBL093C 663 nt6.44□□□□□ -1.38
TY1A-NL1Q12391 SME1YOR159C 285 nt6.44□□□□□ -1.38
TY1A-NL1Q12391 SNF8YPL002C 702 nt6.44□□□□□ -1.38
TY1A-NL1Q12391 RSA1YPL193W 1146 nt6.44□□□□□ -1.38
TY1A-NL1Q12391 YPR127WYPR127W 1038 nt6.44□□□□□ -1.38
TY1A-NL1Q12391 ALG1YBR110W 1350 nt6.44□□□□□ -1.38
TY1A-NL1Q12391 YDL016CYDL016C 303 nt6.43□□□□□ -1.38
TY1A-NL1Q12391 STF1YDL130W-A 261 nt6.43□□□□□ -1.38
TY1A-NL1Q12391 YDL162CYDL162C 357 nt6.43□□□□□ -1.38
TY1A-NL1Q12391 AIM6YDL237W 1173 nt6.43□□□□□ -1.38
TY1A-NL1Q12391 YGL185CYGL185C 1140 nt6.43□□□□□ -1.38
TY1A-NL1Q12391 PRE3YJL001W 648 nt6.43□□□□□ -1.38
TY1A-NL1Q12391 YJL213WYJL213W 996 nt6.43□□□□□ -1.38
TY1A-NL1Q12391 YJL215CYJL215C 360 nt6.43□□□□□ -1.38
TY1A-NL1Q12391 YAL026C-AYAL026C-A 438 nt6.43□□□□□ -1.38
TY1A-NL1Q12391 YKL123WYKL123W 381 nt6.43□□□□□ -1.38
TY1A-NL1Q12391 ERG27YLR100W 1044 nt6.43□□□□□ -1.38
TY1A-NL1Q12391 HMX1YLR205C 954 nt6.43□□□□□ -1.38
TY1A-NL1Q12391 YPT6YLR262C 648 nt6.43□□□□□ -1.38
TY1A-NL1Q12391 YBR056C-BYBR056C-B 159 nt6.43□□□□□ -1.38
TY1A-NL1Q12391 SCD6YPR129W 1050 nt6.43□□□□□ -1.38
TY1A-NL1Q12391 snR19snR19 568 nt6.43□□□□□ -1.38
TY1A-NL1Q12391 ARA1YBR149W 1035 nt6.43□□□□□ -1.38
TY1A-NL1Q12391 STE50YCL032W 1041 nt6.43□□□□□ -1.38
TY1A-NL1Q12391 SSC1YJR045C 1965 nt6.43□□□□□ -1.38
TY1A-NL1Q12391 YHR177WYHR177W 1362 nt6.43□□□□□ -1.38
TY1A-NL1Q12391 HST1YOL068C 1512 nt6.42□□□□□ -1.38
TY1A-NL1Q12391 YGR026WYGR026W 837 nt6.42□□□□□ -1.38
TY1A-NL1Q12391 YGR273CYGR273C 525 nt6.42□□□□□ -1.38
TY1A-NL1Q12391 NTG1YAL015C 1200 nt6.42□□□□□ -1.38
TY1A-NL1Q12391 YJR142WYJR142W 1029 nt6.42□□□□□ -1.38
TY1A-NL1Q12391 RPL43AYPR043W 279 nt6.42□□□□□ -1.38
TY1A-NL1Q12391 MSB3YNL293W 1902 nt6.42□□□□□ -1.38
TY1A-NL1Q12391 AMN1YBR158W 1650 nt6.42□□□□□ -1.38
TY1A-NL1Q12391 HRB1YNL004W 1365 nt6.42□□□□□ -1.38
TY1A-NL1Q12391 NUP53YMR153W 1428 nt6.42□□□□□ -1.38
TY1A-NL1Q12391 CRN1YLR429W 1956 nt6.41□□□□□ -1.38
TY1A-NL1Q12391 snR63snR63 255 nt6.41□□□□□ -1.38
TY1A-NL1Q12391 PFA5YDR459C 1125 nt6.41□□□□□ -1.38
TY1A-NL1Q12391 PAD1YDR538W 729 nt6.41□□□□□ -1.38
TY1A-NL1Q12391 PET117YER058W 324 nt6.41□□□□□ -1.38
TY1A-NL1Q12391 HAP2YGL237C 798 nt6.41□□□□□ -1.38
TY1A-NL1Q12391 CUP1-1YHR053C 186 nt6.41□□□□□ -1.38
TY1A-NL1Q12391 CUP1-2YHR055C 186 nt6.41□□□□□ -1.38
TY1A-NL1Q12391 AIM22YJL046W 1230 nt6.41□□□□□ -1.38
TY1A-NL1Q12391 SPC34YKR037C 888 nt6.41□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 18.7 ms