RNA–Protein interactions for RNA: YJL215C

YJL215C, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YJL215C, Length 360 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YJL215CYJL215C DRS1P32892 752 aaKnown RBP14.22□□□□□ -0.13
YJL215CYJL215C MTC1P47018 478 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
YJL215CYJL215C BFR2Q06631 534 aaKnown RBP12.53□□□□□ -0.4
YJL215CYJL215C TFA1P36100 482 aa12.11□□□□□ -0.47
YJL215CYJL215C DIP2Q12220 943 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
YJL215CYJL215C AVT3P36062 692 aa11.86□□□□□ -0.51
YJL215CYJL215C RSE1Q04693 1361 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
YJL215CYJL215C ISW2Q08773 1120 aa11.04□□□□□ -0.64
YJL215CYJL215C RQC2Q12532 1038 aaKnown RBP10.93□□□□□ -0.66
YJL215CYJL215C RPG1P38249 964 aaKnown RBP10.82□□□□□ -0.68
YJL215CYJL215C RPL17AP05740 184 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
YJL215CYJL215C RPL17BP46990 184 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
YJL215CYJL215C FAP1P53971 965 aa10.67□□□□□ -0.7
YJL215CYJL215C PRI1P10363 409 aa10.66□□□□□ -0.7
YJL215CYJL215C REB1P21538 810 aa10.53□□□□□ -0.72
YJL215CYJL215C AAD16Q02895 342 aa10.44□□□□□ -0.74
YJL215CYJL215C SPT21P35209 758 aa10.27□□□□□ -0.77
YJL215CYJL215C RIM101P33400 625 aa10.26□□□□□ -0.77
YJL215CYJL215C PTP3P40048 928 aa10.25□□□□□ -0.77
YJL215CYJL215C DMA1P38823 416 aa10.16□□□□□ -0.78
YJL215CYJL215C TSR3Q12094 313 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
YJL215CYJL215C SSP1P38871 571 aa10.06□□□□□ -0.8
YJL215CYJL215C OXP1P28273 1286 aa9.93□□□□□ -0.82
YJL215CYJL215C PRY3P47033 881 aa9.92□□□□□ -0.82
YJL215CYJL215C YAH1Q12184 172 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
YJL215CYJL215C ARP8Q12386 881 aaKnown RBP RIP-Chip data9.9□□□□□ -0.82not detected
YJL215CYJL215C YIL055CP40523 627 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
YJL215CYJL215C YKR023WP36119 530 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
YJL215CYJL215C MRPL32P25348 183 aa9.8□□□□□ -0.84
YJL215CYJL215C YLR271WQ06152 274 aa9.76□□□□□ -0.85
YJL215CYJL215C RSM7P47150 247 aa9.69□□□□□ -0.86
YJL215CYJL215C MGA2P40578 1113 aa9.66□□□□□ -0.86
YJL215CYJL215C TFC8Q12308 588 aa9.65□□□□□ -0.86
YJL215CYJL215C HOP09932 586 aa9.64□□□□□ -0.87
YJL215CYJL215C TAF7Q05021 590 aa9.55□□□□□ -0.88
YJL215CYJL215C DCD1P06773 312 aa9.53□□□□□ -0.88
YJL215CYJL215C LEO1P38439 464 aa9.53□□□□□ -0.88
YJL215CYJL215C CDC27P38042 758 aa9.49□□□□□ -0.89
YJL215CYJL215C CST9Q06032 482 aa9.48□□□□□ -0.89
YJL215CYJL215C AI2P03876 854 aa9.47□□□□□ -0.89
YJL215CYJL215C SAS10Q12136 610 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
YJL215CYJL215C PSD2P53037 1138 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
YJL215CYJL215C BBC1P47068 1157 aa9.44□□□□□ -0.9
YJL215CYJL215C HAA1Q12753 694 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
YJL215CYJL215C BCH2P36122 765 aa9.39□□□□□ -0.91
YJL215CYJL215C LEU3P08638 886 aa9.36□□□□□ -0.91
YJL215CYJL215C YCK3P39962 524 aa9.29□□□□□ -0.92
YJL215CYJL215C EPS1P40557 701 aa9.27□□□□□ -0.93
YJL215CYJL215C MRM1P25270 412 aa9.21□□□□□ -0.94
YJL215CYJL215C RAM2P29703 316 aa9.21□□□□□ -0.94
YJL215CYJL215C BDF1P35817 686 aa9.19□□□□□ -0.94
YJL215CYJL215C SET1P38827 1080 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
YJL215CYJL215C RTG3P38165 486 aa9.15□□□□□ -0.94
YJL215CYJL215C SCY1P53009 804 aa9.15□□□□□ -0.94
YJL215CYJL215C IFH1P39520 1085 aa9.13□□□□□ -0.95
YJL215CYJL215C CKB1P43639 278 aa9.11□□□□□ -0.95
YJL215CYJL215C UBP10P53874 792 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
YJL215CYJL215C RCR1P38212 213 aa9.1□□□□□ -0.95
YJL215CYJL215C RPN1P38764 993 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
YJL215CYJL215C SPB4P25808 606 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
YJL215CYJL215C MAK11P20484 414 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
YJL215CYJL215C VPS70P47161 811 aa9.07□□□□□ -0.96
YJL215CYJL215C YPR148CQ06523 435 aa9.07□□□□□ -0.96
YJL215CYJL215C MAP2P38174 421 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
YJL215CYJL215C YGL015CP33199 130 aa9□□□□□ -0.97
YJL215CYJL215C SLX5P32828 619 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
YJL215CYJL215C VPS29P38759 282 aa8.95□□□□□ -0.98
YJL215CYJL215C COQ8P27697 501 aa8.93□□□□□ -0.98
YJL215CYJL215C NOP53Q12080 455 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
YJL215CYJL215C YMR1P47147 688 aaKnown RBP RIP-Chip data8.9□□□□□ -0.98not detected
YJL215CYJL215C PBS2P08018 668 aa8.88□□□□□ -0.99
YJL215CYJL215C DSF2P38213 736 aa8.88□□□□□ -0.99
YJL215CYJL215C MIF2P35201 549 aa8.86□□□□□ -0.99
YJL215CYJL215C DMA2P53924 522 aa8.85□□□□□ -0.99
YJL215CYJL215C DBP1P24784 617 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
YJL215CYJL215C STS1P38637 319 aa8.81□□□□□ -1
YJL215CYJL215C REF2P42073 533 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
YJL215CYJL215C YFR006WP43590 535 aa8.78□□□□□ -1
YJL215CYJL215C YNR021WP53723 404 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
YJL215CYJL215C YOR238WQ08634 303 aa8.78□□□□□ -1
YJL215CYJL215C MAM3Q12296 706 aa8.78□□□□□ -1
YJL215CYJL215C EDS1P38073 919 aa8.77□□□□□ -1.01
YJL215CYJL215C TIF4632P39936 914 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
YJL215CYJL215C MAK21Q12176 1025 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
YJL215CYJL215C KIN1P13185 1064 aa8.71□□□□□ -1.02
YJL215CYJL215C NSR1P27476 414 aaKnown RBP RIP-Chip data8.71□□□□□ -1.02not detected
YJL215CYJL215C PTC3P34221 468 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
YJL215CYJL215C IES2P40154 320 aa8.7□□□□□ -1.02
YJL215CYJL215C YAP5P40574 245 aa8.69□□□□□ -1.02
YJL215CYJL215C AIM7Q12156 149 aa8.69□□□□□ -1.02
YJL215CYJL215C GLC3P32775 704 aa8.67□□□□□ -1.02
YJL215CYJL215C HGH1P48362 394 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
YJL215CYJL215C COX6P00427 148 aa8.66□□□□□ -1.02
YJL215CYJL215C TGL3P40308 642 aa8.65□□□□□ -1.02
YJL215CYJL215C NUP42P49686 430 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
YJL215CYJL215C RLF2Q12495 606 aa8.64□□□□□ -1.03
YJL215CYJL215C DIT2P21595 489 aa8.63□□□□□ -1.03
YJL215CYJL215C PIB1Q06651 286 aa8.63□□□□□ -1.03
YJL215CYJL215C VMA1P17255 1071 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
YJL215CYJL215C ATH1P48016 1211 aa8.61□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 16.2 ms