Protein–RNA interactions for Protein: Q09428

ABCC8, ATP-binding cassette sub-family C member 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC8Q09428 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
ABCC8Q09428 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC40.97■■■■■ 4.15
ABCC8Q09428 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC40.97■■■■■ 4.15
ABCC8Q09428 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC40.97■■■■■ 4.15
ABCC8Q09428 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC40.97■■■■■ 4.15
ABCC8Q09428 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
ABCC8Q09428 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC40.95■■■■■ 4.15
ABCC8Q09428 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC40.95■■■■■ 4.15
ABCC8Q09428 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
ABCC8Q09428 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
ABCC8Q09428 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC40.95■■■■■ 4.15
ABCC8Q09428 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC40.94■■■■■ 4.14
ABCC8Q09428 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
ABCC8Q09428 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
ABCC8Q09428 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.94■■■■■ 4.14
ABCC8Q09428 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
ABCC8Q09428 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
ABCC8Q09428 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
ABCC8Q09428 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
ABCC8Q09428 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.92■■■■■ 4.14
ABCC8Q09428 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
ABCC8Q09428 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC40.91■■■■■ 4.14
ABCC8Q09428 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
ABCC8Q09428 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC40.91■■■■■ 4.14
ABCC8Q09428 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC40.91■■■■■ 4.14
ABCC8Q09428 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC40.9■■■■■ 4.14
ABCC8Q09428 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC40.89■■■■■ 4.14
ABCC8Q09428 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
ABCC8Q09428 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC40.89■■■■■ 4.14
ABCC8Q09428 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.14
ABCC8Q09428 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC40.88■■■■■ 4.13
ABCC8Q09428 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC40.88■■■■■ 4.13
ABCC8Q09428 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
ABCC8Q09428 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC40.87■■■■■ 4.13
ABCC8Q09428 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
ABCC8Q09428 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.87■■■■■ 4.13
ABCC8Q09428 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC40.86■■■■■ 4.13
ABCC8Q09428 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC40.86■■■■■ 4.13
ABCC8Q09428 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC40.86■■■■■ 4.13
ABCC8Q09428 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC40.86■■■■■ 4.13
ABCC8Q09428 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC40.85■■■■■ 4.13
ABCC8Q09428 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
ABCC8Q09428 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
ABCC8Q09428 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
ABCC8Q09428 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
ABCC8Q09428 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
ABCC8Q09428 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC40.83■■■■■ 4.13
ABCC8Q09428 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
ABCC8Q09428 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
ABCC8Q09428 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC40.82■■■■■ 4.13
ABCC8Q09428 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
ABCC8Q09428 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
ABCC8Q09428 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
ABCC8Q09428 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
ABCC8Q09428 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.81■■■■■ 4.12
ABCC8Q09428 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC40.81■■■■■ 4.12
ABCC8Q09428 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC40.8■■■■■ 4.12
ABCC8Q09428 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC40.8■■■■■ 4.12
ABCC8Q09428 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
ABCC8Q09428 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
ABCC8Q09428 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC40.78■■■■■ 4.12
ABCC8Q09428 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC40.78■■■■■ 4.12
ABCC8Q09428 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.78■■■■■ 4.12
ABCC8Q09428 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC40.78■■■■■ 4.12
ABCC8Q09428 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC40.78■■■■■ 4.12
ABCC8Q09428 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC40.77■■■■■ 4.12
ABCC8Q09428 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.77■■■■■ 4.12
ABCC8Q09428 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC40.77■■■■■ 4.12
ABCC8Q09428 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
ABCC8Q09428 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
ABCC8Q09428 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
ABCC8Q09428 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC40.76■■■■■ 4.12
ABCC8Q09428 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC40.76■■■■■ 4.12
ABCC8Q09428 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC40.76■■■■■ 4.12
ABCC8Q09428 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
ABCC8Q09428 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
ABCC8Q09428 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC40.75■■■■■ 4.11
ABCC8Q09428 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
ABCC8Q09428 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
ABCC8Q09428 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
ABCC8Q09428 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
ABCC8Q09428 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
ABCC8Q09428 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC40.74■■■■■ 4.11
ABCC8Q09428 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.74■■■■■ 4.11
ABCC8Q09428 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC40.74■■■■■ 4.11
ABCC8Q09428 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
ABCC8Q09428 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC40.72■■■■■ 4.11
ABCC8Q09428 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
ABCC8Q09428 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC40.72■■■■■ 4.11
ABCC8Q09428 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
ABCC8Q09428 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
ABCC8Q09428 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
ABCC8Q09428 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.7■■■■■ 4.11
ABCC8Q09428 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC40.7■■■■■ 4.11
ABCC8Q09428 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC40.7■■■■■ 4.11
ABCC8Q09428 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.7■■■■■ 4.11
ABCC8Q09428 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
ABCC8Q09428 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC40.69■■■■■ 4.1
ABCC8Q09428 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
ABCC8Q09428 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.69■■■■■ 4.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms