Protein–RNA interactions for Protein: Q08211

DHX9, ATP-dependent RNA helicase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX9Q08211 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DHX9Q08211 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DHX9Q08211 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DHX9Q08211 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DHX9Q08211 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
DHX9Q08211 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DHX9Q08211 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DHX9Q08211 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DHX9Q08211 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DHX9Q08211 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DHX9Q08211 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DHX9Q08211 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DHX9Q08211 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DHX9Q08211 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DHX9Q08211 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DHX9Q08211 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DHX9Q08211 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DHX9Q08211 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DHX9Q08211 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DHX9Q08211 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DHX9Q08211 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DHX9Q08211 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DHX9Q08211 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DHX9Q08211 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DHX9Q08211 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DHX9Q08211 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DHX9Q08211 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DHX9Q08211 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DHX9Q08211 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DHX9Q08211 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DHX9Q08211 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DHX9Q08211 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DHX9Q08211 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DHX9Q08211 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DHX9Q08211 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
DHX9Q08211 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DHX9Q08211 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DHX9Q08211 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DHX9Q08211 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DHX9Q08211 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DHX9Q08211 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DHX9Q08211 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DHX9Q08211 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DHX9Q08211 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DHX9Q08211 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
DHX9Q08211 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DHX9Q08211 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DHX9Q08211 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DHX9Q08211 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
DHX9Q08211 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DHX9Q08211 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DHX9Q08211 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DHX9Q08211 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DHX9Q08211 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DHX9Q08211 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DHX9Q08211 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DHX9Q08211 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DHX9Q08211 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DHX9Q08211 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DHX9Q08211 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DHX9Q08211 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DHX9Q08211 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DHX9Q08211 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DHX9Q08211 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DHX9Q08211 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DHX9Q08211 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DHX9Q08211 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DHX9Q08211 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DHX9Q08211 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DHX9Q08211 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DHX9Q08211 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DHX9Q08211 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DHX9Q08211 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DHX9Q08211 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DHX9Q08211 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DHX9Q08211 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DHX9Q08211 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DHX9Q08211 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DHX9Q08211 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DHX9Q08211 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DHX9Q08211 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DHX9Q08211 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DHX9Q08211 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
DHX9Q08211 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DHX9Q08211 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DHX9Q08211 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DHX9Q08211 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DHX9Q08211 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DHX9Q08211 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
DHX9Q08211 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DHX9Q08211 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DHX9Q08211 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DHX9Q08211 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DHX9Q08211 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DHX9Q08211 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
DHX9Q08211 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DHX9Q08211 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DHX9Q08211 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DHX9Q08211 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DHX9Q08211 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms