Protein–RNA interactions for Protein: Q06787

FMR1, Synaptic functional regulator FMR1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMR1Q06787 MAPRE2-206ENST00000587359 584 ntTSL 58.07□□□□□ -1.122e-8■■■■■ 32.3
FMR1Q06787 SLF2-202ENST00000370269 3712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.152e-8■■■■■ 32.3
FMR1Q06787 MAPRE2-210ENST00000589180 553 ntTSL 57.77□□□□□ -1.172e-8■■■■■ 32.3
FMR1Q06787 MAPRE2-203ENST00000436190 4323 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.22e-8■■■■■ 32.3
FMR1Q06787 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.392e-8■■■■■ 32.3
FMR1Q06787 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.651e-6■■■■■ 32.3
FMR1Q06787 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.043e-8■■■■■ 32.3
FMR1Q06787 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.763e-8■■■■■ 32.3
FMR1Q06787 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.683e-8■■■■■ 32.3
FMR1Q06787 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.612e-6■■■■■ 32.2
FMR1Q06787 PI4KB-211ENST00000489223 558 ntTSL 418.81■□□□□ 0.63e-6■■■■■ 32.2
FMR1Q06787 PHIP-201ENST00000275034 10460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.022e-7■■■■■ 32.1
FMR1Q06787 KLC1-209ENST00000535194 710 ntTSL 325.16■■□□□ 1.622e-7■■■■■ 32.1
FMR1Q06787 KLC1-210ENST00000537046 875 ntTSL 316.96■□□□□ 0.312e-7■■■■■ 32.1
FMR1Q06787 CDC42BPA-206ENST00000429440 2501 ntTSL 29.7□□□□□ -0.861e-6■■■■■ 32.1
FMR1Q06787 ARL4A-203ENST00000396663 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.081e-17■■■■■ 32.1
FMR1Q06787 ARL4A-202ENST00000396662 1296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.151e-17■■■■■ 32.1
FMR1Q06787 ARL4A-201ENST00000356797 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.841e-17■■■■■ 32.1
FMR1Q06787 ARL4A-204ENST00000396664 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.341e-17■■■■■ 32.1
FMR1Q06787 CPED1-204ENST00000428526 2219 ntTSL 29.2□□□□□ -0.941e-6■■■■■ 32
FMR1Q06787 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.932e-7■■■■■ 32
FMR1Q06787 CD63-207ENST00000548898 727 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.112e-7■■■■■ 32
FMR1Q06787 VCP-202ENST00000417448 722 ntTSL 324.05■■□□□ 1.443e-10■■■■■ 32
FMR1Q06787 VARS-228ENST00000495010 1007 ntTSL 518.78■□□□□ 0.61e-7■■■■■ 31.9
FMR1Q06787 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.653e-7■■■■■ 31.9
FMR1Q06787 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.543e-7■■■■■ 31.9
FMR1Q06787 DDX20-204ENST00000533164 1499 ntTSL 527.06■■□□□ 1.925e-9■■■■■ 31.9
FMR1Q06787 TNRC18-204ENST00000413081 925 ntTSL 324.89■■□□□ 1.582e-7■■■■■ 31.9
FMR1Q06787 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.475e-9■■■■■ 31.9
FMR1Q06787 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.325e-9■■■■■ 31.9
FMR1Q06787 AC134772.2-203ENST00000635452 2197 ntAPPRIS P1 TSL 222.63■■□□□ 1.215e-9■■■■■ 31.9
FMR1Q06787 PAXBP1-204ENST00000443785 2920 ntTSL 1 (best)21.83■■□□□ 1.095e-9■■■■■ 31.9
FMR1Q06787 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.035e-9■■■■■ 31.9
FMR1Q06787 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 15e-9■■■■■ 31.9
FMR1Q06787 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.845e-9■■■■■ 31.9
FMR1Q06787 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.665e-9■■■■■ 31.9
FMR1Q06787 METAP2-203ENST00000535095 2431 ntTSL 217.77■□□□□ 0.446e-17■■■■■ 31.9
FMR1Q06787 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.425e-9■■■■■ 31.9
FMR1Q06787 PRH1-205ENST00000541977 507 ntTSL 217.64■□□□□ 0.415e-9■■■■■ 31.9
FMR1Q06787 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.375e-9■■■■■ 31.9
FMR1Q06787 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.326e-17■■■■■ 31.9
FMR1Q06787 DNAH14-218ENST00000498360 951 ntTSL 316.58■□□□□ 0.245e-9■■■■■ 31.9
FMR1Q06787 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.235e-9■■■■■ 31.9
FMR1Q06787 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.225e-9■■■■■ 31.9
FMR1Q06787 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.215e-9■■■■■ 31.9
FMR1Q06787 AC023509.3-202ENST00000591834 1609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.175e-9■■■■■ 31.9
FMR1Q06787 SPTBN2-207ENST00000532650 571 ntTSL 215.88■□□□□ 0.135e-9■■■■■ 31.9
FMR1Q06787 AC134772.2-201ENST00000635464 3943 ntTSL 515.8■□□□□ 0.125e-9■■■■■ 31.9
FMR1Q06787 AC134772.2-202ENST00000634384 3585 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.045e-9■■■■■ 31.9
FMR1Q06787 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.058e-8■■■■■ 31.9
FMR1Q06787 AKAP8-204ENST00000598597 3071 ntTSL 1 (best)14.71□□□□□ -0.055e-9■■■■■ 31.9
FMR1Q06787 TAS2R14-201ENST00000381852 1662 ntTSL 214.51□□□□□ -0.095e-9■■■■■ 31.9
FMR1Q06787 PRR4-213ENST00000546265 534 ntTSL 514.31□□□□□ -0.125e-9■■■■■ 31.9
FMR1Q06787 PRR4-203ENST00000535024 889 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.125e-9■■■■■ 31.9
FMR1Q06787 METAP2-209ENST00000550777 1779 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.126e-17■■■■■ 31.9
FMR1Q06787 AKAP8-201ENST00000269701 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.125e-9■■■■■ 31.9
FMR1Q06787 ATF7-210ENST00000588232 531 ntTSL 414.07□□□□□ -0.165e-9■■■■■ 31.9
FMR1Q06787 METAP2-201ENST00000261220 1836 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.196e-17■■■■■ 31.9
FMR1Q06787 UTP20-203ENST00000551825 1585 ntTSL 1 (best)13.3□□□□□ -0.285e-9■■■■■ 31.9
FMR1Q06787 AC006504.5-209ENST00000591549 500 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.315e-9■■■■■ 31.9
FMR1Q06787 RHBDD1-201ENST00000341329 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.335e-9■■■■■ 31.9
FMR1Q06787 LINC00958-201ENST00000504230 1558 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.355e-9■■■■■ 31.9
FMR1Q06787 AC006504.5-206ENST00000585917 719 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.395e-9■■■■■ 31.9
FMR1Q06787 AC018630.6-201ENST00000536668 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.445e-9■■■■■ 31.9
FMR1Q06787 METAP2-210ENST00000551840 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.56e-17■■■■■ 31.9
FMR1Q06787 LINC00958-203ENST00000527945 1121 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.585e-9■■■■■ 31.9
FMR1Q06787 RHBDD1-203ENST00000409053 538 ntTSL 4 BASIC11.36□□□□□ -0.595e-9■■■■■ 31.9
FMR1Q06787 METAP2-202ENST00000323666 3601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.716e-17■■■■■ 31.9
FMR1Q06787 RHBDD1-214ENST00000493526 1003 ntTSL 310.56□□□□□ -0.725e-9■■■■■ 31.9
FMR1Q06787 LINC00958-207ENST00000534477 888 ntTSL 310.44□□□□□ -0.745e-9■■■■■ 31.9
FMR1Q06787 LINC00958-206ENST00000532541 1124 ntTSL 310.44□□□□□ -0.745e-9■■■■■ 31.9
FMR1Q06787 AC104806.2-201ENST00000502400 1991 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.745e-9■■■■■ 31.9
FMR1Q06787 ATF7-201ENST00000420353 6680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.775e-9■■■■■ 31.9
FMR1Q06787 RHBDD1-202ENST00000392062 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.795e-9■■■■■ 31.9
FMR1Q06787 ATF7-202ENST00000456903 5218 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.795e-9■■■■■ 31.9
FMR1Q06787 LINC00958-202ENST00000526388 607 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.85e-9■■■■■ 31.9
FMR1Q06787 RAD50-205ENST00000453394 2076 ntTSL 59.61□□□□□ -0.872e-6■■■■■ 31.9
FMR1Q06787 PAXBP1-209ENST00000497873 2277 ntTSL 29.59□□□□□ -0.875e-9■■■■■ 31.9
FMR1Q06787 ATF7-209ENST00000588078 531 ntTSL 59.22□□□□□ -0.935e-9■■■■■ 31.9
FMR1Q06787 RHBDD1-213ENST00000491490 801 ntTSL 1 (best)9.09□□□□□ -0.955e-9■■■■■ 31.9
FMR1Q06787 PRR4-208ENST00000541175 384 ntTSL 28.98□□□□□ -0.975e-9■■■■■ 31.9
FMR1Q06787 AC006504.7-201ENST00000592806 924 ntTSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.035e-9■■■■■ 31.9
FMR1Q06787 AC006504.5-212ENST00000587188 746 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.065e-9■■■■■ 31.9
FMR1Q06787 AC006504.5-201ENST00000588122 655 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.085e-9■■■■■ 31.9
FMR1Q06787 ATF7-208ENST00000551480 473 ntTSL 58.04□□□□□ -1.125e-9■■■■■ 31.9
FMR1Q06787 RBBP7-206ENST00000425696 373 ntTSL 57.81□□□□□ -1.165e-9■■■■■ 31.9
FMR1Q06787 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.315e-9■■■■■ 31.9
FMR1Q06787 AC006504.5-202ENST00000586784 656 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.395e-9■■■■■ 31.9
FMR1Q06787 LINC00958-205ENST00000531402 590 ntTSL 45.64□□□□□ -1.515e-9■■■■■ 31.9
FMR1Q06787 ARHGAP21-215ENST00000486374 6846 ntTSL 25.62□□□□□ -1.515e-9■■■■■ 31.9
FMR1Q06787 RAD50-203ENST00000423956 2915 ntTSL 55.38□□□□□ -1.552e-6■■■■■ 31.9
FMR1Q06787 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.65e-9■■■■■ 31.9
FMR1Q06787 PAXBP1-207ENST00000466846 3879 ntTSL 24□□□□□ -1.775e-9■■■■■ 31.9
FMR1Q06787 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.85e-9■■■■■ 31.9
FMR1Q06787 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.377e-7■■■■■ 31.9
FMR1Q06787 PRPF40A-202ENST00000410080 8048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.577e-7■■■■■ 31.8
FMR1Q06787 FLNA-216ENST00000490936 5374 ntTSL 1 (best)16.84■□□□□ 0.296e-15■■■■■ 31.8
FMR1Q06787 PRPF8-204ENST00000572445 648 ntTSL 28.25□□□□□ -1.092e-9■■■■■ 31.7
FMR1Q06787 SPTBN2-208ENST00000532902 573 ntTSL 219.68■□□□□ 0.748e-8■■■■■ 31.7
FMR1Q06787 FHOD1-202ENST00000561922 2069 ntTSL 223.68■■□□□ 1.384e-11■■■■■ 31.7
Retrieved 100 of 13,491 protein–RNA pairs in 59.7 ms