Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNP2Q05952 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNP2Q05952 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNP2Q05952 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNP2Q05952 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TNP2Q05952 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNP2Q05952 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNP2Q05952 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TNP2Q05952 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNP2Q05952 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNP2Q05952 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNP2Q05952 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNP2Q05952 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNP2Q05952 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TNP2Q05952 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNP2Q05952 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNP2Q05952 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNP2Q05952 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNP2Q05952 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNP2Q05952 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNP2Q05952 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNP2Q05952 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNP2Q05952 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNP2Q05952 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNP2Q05952 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNP2Q05952 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNP2Q05952 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNP2Q05952 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNP2Q05952 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNP2Q05952 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNP2Q05952 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNP2Q05952 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNP2Q05952 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNP2Q05952 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNP2Q05952 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNP2Q05952 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNP2Q05952 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNP2Q05952 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNP2Q05952 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNP2Q05952 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNP2Q05952 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNP2Q05952 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNP2Q05952 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNP2Q05952 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNP2Q05952 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNP2Q05952 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNP2Q05952 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNP2Q05952 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNP2Q05952 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TNP2Q05952 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNP2Q05952 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNP2Q05952 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNP2Q05952 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TNP2Q05952 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TNP2Q05952 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TNP2Q05952 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNP2Q05952 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TNP2Q05952 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TNP2Q05952 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNP2Q05952 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNP2Q05952 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNP2Q05952 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNP2Q05952 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNP2Q05952 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNP2Q05952 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNP2Q05952 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TNP2Q05952 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNP2Q05952 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TNP2Q05952 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNP2Q05952 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNP2Q05952 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNP2Q05952 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNP2Q05952 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNP2Q05952 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNP2Q05952 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNP2Q05952 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNP2Q05952 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNP2Q05952 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TNP2Q05952 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNP2Q05952 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNP2Q05952 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNP2Q05952 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TNP2Q05952 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNP2Q05952 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNP2Q05952 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TNP2Q05952 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNP2Q05952 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNP2Q05952 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNP2Q05952 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNP2Q05952 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNP2Q05952 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNP2Q05952 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNP2Q05952 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNP2Q05952 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNP2Q05952 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNP2Q05952 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNP2Q05952 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNP2Q05952 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNP2Q05952 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNP2Q05952 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms