Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
TMF1P82094 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
TMF1P82094 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
TMF1P82094 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
TMF1P82094 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
TMF1P82094 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
TMF1P82094 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
TMF1P82094 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
TMF1P82094 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
TMF1P82094 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
TMF1P82094 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
TMF1P82094 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
TMF1P82094 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
TMF1P82094 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
TMF1P82094 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
TMF1P82094 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
TMF1P82094 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
TMF1P82094 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
TMF1P82094 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
TMF1P82094 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
TMF1P82094 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
TMF1P82094 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
TMF1P82094 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
TMF1P82094 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
TMF1P82094 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
TMF1P82094 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
TMF1P82094 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
TMF1P82094 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
TMF1P82094 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
TMF1P82094 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
TMF1P82094 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
TMF1P82094 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
TMF1P82094 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
TMF1P82094 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
TMF1P82094 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
TMF1P82094 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
TMF1P82094 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
TMF1P82094 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
TMF1P82094 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
TMF1P82094 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
TMF1P82094 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
TMF1P82094 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
TMF1P82094 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
TMF1P82094 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
TMF1P82094 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
TMF1P82094 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
TMF1P82094 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
TMF1P82094 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
TMF1P82094 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
TMF1P82094 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
TMF1P82094 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
TMF1P82094 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
TMF1P82094 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
TMF1P82094 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
TMF1P82094 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
TMF1P82094 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
TMF1P82094 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
TMF1P82094 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
TMF1P82094 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
TMF1P82094 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
TMF1P82094 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
TMF1P82094 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
TMF1P82094 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
TMF1P82094 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
TMF1P82094 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
TMF1P82094 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
TMF1P82094 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
TMF1P82094 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
TMF1P82094 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
TMF1P82094 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
TMF1P82094 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
TMF1P82094 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
TMF1P82094 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
TMF1P82094 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC32.78■■■□□ 2.84
TMF1P82094 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
TMF1P82094 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
TMF1P82094 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
TMF1P82094 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
TMF1P82094 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
TMF1P82094 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
TMF1P82094 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
TMF1P82094 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
TMF1P82094 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
TMF1P82094 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
TMF1P82094 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
TMF1P82094 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
TMF1P82094 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
TMF1P82094 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
TMF1P82094 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
TMF1P82094 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
TMF1P82094 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
TMF1P82094 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
TMF1P82094 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
TMF1P82094 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
TMF1P82094 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
TMF1P82094 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC32.74■■■□□ 2.83
TMF1P82094 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
TMF1P82094 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
TMF1P82094 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
TMF1P82094 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms