Protein–RNA interactions for Protein: P78385

KRT83, Keratin, type II cuticular Hb3, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT83P78385 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT83P78385 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT83P78385 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT83P78385 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT83P78385 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT83P78385 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT83P78385 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT83P78385 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT83P78385 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT83P78385 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT83P78385 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT83P78385 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT83P78385 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT83P78385 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT83P78385 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT83P78385 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT83P78385 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT83P78385 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT83P78385 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT83P78385 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT83P78385 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT83P78385 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT83P78385 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT83P78385 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT83P78385 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT83P78385 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT83P78385 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT83P78385 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT83P78385 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT83P78385 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT83P78385 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT83P78385 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT83P78385 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT83P78385 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT83P78385 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT83P78385 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT83P78385 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT83P78385 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT83P78385 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT83P78385 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT83P78385 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT83P78385 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT83P78385 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT83P78385 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT83P78385 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT83P78385 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT83P78385 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT83P78385 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT83P78385 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT83P78385 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT83P78385 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT83P78385 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT83P78385 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT83P78385 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT83P78385 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT83P78385 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT83P78385 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT83P78385 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT83P78385 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT83P78385 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT83P78385 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT83P78385 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT83P78385 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT83P78385 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT83P78385 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT83P78385 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT83P78385 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT83P78385 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT83P78385 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT83P78385 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT83P78385 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT83P78385 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT83P78385 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT83P78385 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT83P78385 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT83P78385 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT83P78385 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT83P78385 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
KRT83P78385 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KRT83P78385 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
KRT83P78385 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT83P78385 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT83P78385 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT83P78385 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT83P78385 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT83P78385 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT83P78385 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT83P78385 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT83P78385 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT83P78385 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT83P78385 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT83P78385 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT83P78385 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT83P78385 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT83P78385 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT83P78385 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT83P78385 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT83P78385 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT83P78385 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT83P78385 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms