Protein–RNA interactions for Protein: P69849

NOMO3, Nodal modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3P69849 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NOMO3P69849 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NOMO3P69849 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NOMO3P69849 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NOMO3P69849 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
NOMO3P69849 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NOMO3P69849 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NOMO3P69849 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NOMO3P69849 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NOMO3P69849 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NOMO3P69849 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NOMO3P69849 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NOMO3P69849 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NOMO3P69849 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NOMO3P69849 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NOMO3P69849 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NOMO3P69849 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NOMO3P69849 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NOMO3P69849 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NOMO3P69849 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NOMO3P69849 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NOMO3P69849 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NOMO3P69849 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NOMO3P69849 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NOMO3P69849 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NOMO3P69849 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NOMO3P69849 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NOMO3P69849 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NOMO3P69849 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NOMO3P69849 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NOMO3P69849 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NOMO3P69849 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NOMO3P69849 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NOMO3P69849 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NOMO3P69849 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NOMO3P69849 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NOMO3P69849 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NOMO3P69849 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NOMO3P69849 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NOMO3P69849 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NOMO3P69849 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NOMO3P69849 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NOMO3P69849 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NOMO3P69849 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NOMO3P69849 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NOMO3P69849 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NOMO3P69849 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NOMO3P69849 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NOMO3P69849 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NOMO3P69849 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NOMO3P69849 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NOMO3P69849 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NOMO3P69849 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NOMO3P69849 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NOMO3P69849 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NOMO3P69849 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NOMO3P69849 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NOMO3P69849 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NOMO3P69849 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NOMO3P69849 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NOMO3P69849 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NOMO3P69849 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NOMO3P69849 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NOMO3P69849 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NOMO3P69849 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NOMO3P69849 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NOMO3P69849 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NOMO3P69849 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NOMO3P69849 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NOMO3P69849 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NOMO3P69849 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NOMO3P69849 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NOMO3P69849 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NOMO3P69849 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NOMO3P69849 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NOMO3P69849 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NOMO3P69849 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NOMO3P69849 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NOMO3P69849 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NOMO3P69849 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NOMO3P69849 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NOMO3P69849 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NOMO3P69849 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NOMO3P69849 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NOMO3P69849 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NOMO3P69849 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NOMO3P69849 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NOMO3P69849 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NOMO3P69849 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NOMO3P69849 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NOMO3P69849 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NOMO3P69849 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NOMO3P69849 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NOMO3P69849 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NOMO3P69849 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NOMO3P69849 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NOMO3P69849 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NOMO3P69849 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NOMO3P69849 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NOMO3P69849 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms