Protein–RNA interactions for Protein: P63173

RPL38, 60S ribosomal protein L38, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL38P63173 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPL38P63173 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPL38P63173 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPL38P63173 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPL38P63173 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPL38P63173 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPL38P63173 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPL38P63173 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPL38P63173 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPL38P63173 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPL38P63173 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPL38P63173 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPL38P63173 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPL38P63173 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPL38P63173 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPL38P63173 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPL38P63173 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPL38P63173 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPL38P63173 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPL38P63173 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPL38P63173 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPL38P63173 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPL38P63173 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPL38P63173 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RPL38P63173 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RPL38P63173 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RPL38P63173 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RPL38P63173 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPL38P63173 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPL38P63173 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPL38P63173 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPL38P63173 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPL38P63173 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPL38P63173 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPL38P63173 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPL38P63173 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPL38P63173 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPL38P63173 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPL38P63173 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPL38P63173 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPL38P63173 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPL38P63173 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPL38P63173 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPL38P63173 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPL38P63173 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPL38P63173 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPL38P63173 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPL38P63173 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPL38P63173 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RPL38P63173 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RPL38P63173 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPL38P63173 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPL38P63173 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPL38P63173 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPL38P63173 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPL38P63173 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPL38P63173 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPL38P63173 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPL38P63173 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPL38P63173 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RPL38P63173 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPL38P63173 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPL38P63173 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPL38P63173 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RPL38P63173 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPL38P63173 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPL38P63173 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPL38P63173 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPL38P63173 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPL38P63173 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPL38P63173 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPL38P63173 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RPL38P63173 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPL38P63173 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPL38P63173 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPL38P63173 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPL38P63173 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPL38P63173 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPL38P63173 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPL38P63173 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPL38P63173 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPL38P63173 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPL38P63173 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPL38P63173 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPL38P63173 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPL38P63173 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPL38P63173 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPL38P63173 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPL38P63173 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPL38P63173 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPL38P63173 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPL38P63173 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RPL38P63173 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPL38P63173 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPL38P63173 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPL38P63173 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPL38P63173 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPL38P63173 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPL38P63173 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPL38P63173 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms