Protein–RNA interactions for Protein: P61812

TGFB2, Transforming growth factor beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFB2P61812 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TGFB2P61812 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TGFB2P61812 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TGFB2P61812 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TGFB2P61812 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TGFB2P61812 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TGFB2P61812 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TGFB2P61812 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TGFB2P61812 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TGFB2P61812 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TGFB2P61812 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TGFB2P61812 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TGFB2P61812 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
TGFB2P61812 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
TGFB2P61812 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TGFB2P61812 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TGFB2P61812 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TGFB2P61812 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TGFB2P61812 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TGFB2P61812 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TGFB2P61812 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TGFB2P61812 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TGFB2P61812 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TGFB2P61812 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TGFB2P61812 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TGFB2P61812 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
TGFB2P61812 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TGFB2P61812 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TGFB2P61812 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TGFB2P61812 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TGFB2P61812 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TGFB2P61812 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TGFB2P61812 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TGFB2P61812 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TGFB2P61812 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TGFB2P61812 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
TGFB2P61812 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TGFB2P61812 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
TGFB2P61812 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
TGFB2P61812 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TGFB2P61812 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TGFB2P61812 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TGFB2P61812 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TGFB2P61812 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
TGFB2P61812 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
TGFB2P61812 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TGFB2P61812 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TGFB2P61812 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TGFB2P61812 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TGFB2P61812 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
TGFB2P61812 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TGFB2P61812 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TGFB2P61812 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TGFB2P61812 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TGFB2P61812 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TGFB2P61812 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TGFB2P61812 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TGFB2P61812 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TGFB2P61812 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TGFB2P61812 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TGFB2P61812 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TGFB2P61812 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TGFB2P61812 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TGFB2P61812 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TGFB2P61812 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TGFB2P61812 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TGFB2P61812 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TGFB2P61812 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TGFB2P61812 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TGFB2P61812 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TGFB2P61812 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TGFB2P61812 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
TGFB2P61812 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
TGFB2P61812 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TGFB2P61812 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TGFB2P61812 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TGFB2P61812 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TGFB2P61812 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TGFB2P61812 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TGFB2P61812 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
TGFB2P61812 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TGFB2P61812 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TGFB2P61812 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TGFB2P61812 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TGFB2P61812 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TGFB2P61812 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TGFB2P61812 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
TGFB2P61812 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TGFB2P61812 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TGFB2P61812 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TGFB2P61812 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TGFB2P61812 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TGFB2P61812 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
TGFB2P61812 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TGFB2P61812 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TGFB2P61812 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TGFB2P61812 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
TGFB2P61812 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TGFB2P61812 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TGFB2P61812 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms