Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ERVK-21P61565 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ERVK-21P61565 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERVK-21P61565 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ERVK-21P61565 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ERVK-21P61565 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERVK-21P61565 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERVK-21P61565 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERVK-21P61565 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERVK-21P61565 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERVK-21P61565 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ERVK-21P61565 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ERVK-21P61565 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ERVK-21P61565 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERVK-21P61565 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERVK-21P61565 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERVK-21P61565 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ERVK-21P61565 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERVK-21P61565 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERVK-21P61565 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ERVK-21P61565 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERVK-21P61565 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERVK-21P61565 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERVK-21P61565 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERVK-21P61565 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ERVK-21P61565 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERVK-21P61565 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERVK-21P61565 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERVK-21P61565 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERVK-21P61565 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERVK-21P61565 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ERVK-21P61565 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERVK-21P61565 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERVK-21P61565 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERVK-21P61565 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERVK-21P61565 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERVK-21P61565 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERVK-21P61565 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERVK-21P61565 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERVK-21P61565 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERVK-21P61565 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERVK-21P61565 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERVK-21P61565 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERVK-21P61565 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERVK-21P61565 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERVK-21P61565 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERVK-21P61565 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERVK-21P61565 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERVK-21P61565 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERVK-21P61565 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ERVK-21P61565 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERVK-21P61565 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERVK-21P61565 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ERVK-21P61565 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERVK-21P61565 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERVK-21P61565 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERVK-21P61565 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERVK-21P61565 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ERVK-21P61565 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERVK-21P61565 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERVK-21P61565 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERVK-21P61565 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERVK-21P61565 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERVK-21P61565 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERVK-21P61565 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERVK-21P61565 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERVK-21P61565 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ERVK-21P61565 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERVK-21P61565 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERVK-21P61565 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERVK-21P61565 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERVK-21P61565 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERVK-21P61565 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERVK-21P61565 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ERVK-21P61565 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERVK-21P61565 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERVK-21P61565 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERVK-21P61565 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERVK-21P61565 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERVK-21P61565 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERVK-21P61565 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERVK-21P61565 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERVK-21P61565 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERVK-21P61565 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERVK-21P61565 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERVK-21P61565 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ERVK-21P61565 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERVK-21P61565 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERVK-21P61565 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERVK-21P61565 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERVK-21P61565 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERVK-21P61565 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERVK-21P61565 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERVK-21P61565 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERVK-21P61565 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERVK-21P61565 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERVK-21P61565 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERVK-21P61565 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERVK-21P61565 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERVK-21P61565 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.4 ms