Protein–RNA interactions for Protein: P61201

COPS2, COP9 signalosome complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS2P61201 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COPS2P61201 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
COPS2P61201 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COPS2P61201 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COPS2P61201 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
COPS2P61201 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COPS2P61201 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
COPS2P61201 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COPS2P61201 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COPS2P61201 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COPS2P61201 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COPS2P61201 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COPS2P61201 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COPS2P61201 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COPS2P61201 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COPS2P61201 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COPS2P61201 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COPS2P61201 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COPS2P61201 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COPS2P61201 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
COPS2P61201 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COPS2P61201 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COPS2P61201 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COPS2P61201 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COPS2P61201 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COPS2P61201 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COPS2P61201 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COPS2P61201 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
COPS2P61201 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COPS2P61201 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COPS2P61201 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
COPS2P61201 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COPS2P61201 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COPS2P61201 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COPS2P61201 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COPS2P61201 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COPS2P61201 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COPS2P61201 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COPS2P61201 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COPS2P61201 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COPS2P61201 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COPS2P61201 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COPS2P61201 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COPS2P61201 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COPS2P61201 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COPS2P61201 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COPS2P61201 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
COPS2P61201 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COPS2P61201 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COPS2P61201 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COPS2P61201 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COPS2P61201 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
COPS2P61201 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
COPS2P61201 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COPS2P61201 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
COPS2P61201 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COPS2P61201 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COPS2P61201 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COPS2P61201 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COPS2P61201 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
COPS2P61201 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COPS2P61201 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COPS2P61201 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COPS2P61201 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COPS2P61201 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COPS2P61201 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COPS2P61201 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COPS2P61201 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COPS2P61201 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COPS2P61201 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COPS2P61201 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COPS2P61201 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COPS2P61201 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COPS2P61201 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COPS2P61201 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COPS2P61201 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COPS2P61201 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COPS2P61201 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COPS2P61201 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COPS2P61201 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COPS2P61201 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COPS2P61201 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COPS2P61201 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COPS2P61201 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COPS2P61201 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COPS2P61201 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COPS2P61201 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
COPS2P61201 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
COPS2P61201 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COPS2P61201 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COPS2P61201 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COPS2P61201 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COPS2P61201 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COPS2P61201 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COPS2P61201 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COPS2P61201 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COPS2P61201 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COPS2P61201 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COPS2P61201 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COPS2P61201 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms