Protein–RNA interactions for Protein: P61158

ACTR3, Actin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3P61158 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTR3P61158 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTR3P61158 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTR3P61158 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTR3P61158 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTR3P61158 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTR3P61158 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTR3P61158 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTR3P61158 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTR3P61158 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTR3P61158 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTR3P61158 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTR3P61158 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTR3P61158 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTR3P61158 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTR3P61158 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTR3P61158 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTR3P61158 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTR3P61158 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTR3P61158 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTR3P61158 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTR3P61158 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTR3P61158 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTR3P61158 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTR3P61158 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTR3P61158 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTR3P61158 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTR3P61158 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTR3P61158 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTR3P61158 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTR3P61158 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTR3P61158 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTR3P61158 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTR3P61158 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTR3P61158 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTR3P61158 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTR3P61158 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTR3P61158 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTR3P61158 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTR3P61158 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTR3P61158 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTR3P61158 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTR3P61158 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTR3P61158 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTR3P61158 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTR3P61158 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTR3P61158 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTR3P61158 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTR3P61158 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTR3P61158 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTR3P61158 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTR3P61158 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTR3P61158 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTR3P61158 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTR3P61158 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTR3P61158 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTR3P61158 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTR3P61158 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTR3P61158 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTR3P61158 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTR3P61158 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTR3P61158 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTR3P61158 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTR3P61158 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTR3P61158 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ACTR3P61158 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ACTR3P61158 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACTR3P61158 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACTR3P61158 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACTR3P61158 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACTR3P61158 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACTR3P61158 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACTR3P61158 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTR3P61158 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTR3P61158 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTR3P61158 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTR3P61158 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTR3P61158 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTR3P61158 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTR3P61158 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTR3P61158 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTR3P61158 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTR3P61158 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTR3P61158 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTR3P61158 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTR3P61158 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTR3P61158 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTR3P61158 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTR3P61158 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTR3P61158 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTR3P61158 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTR3P61158 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTR3P61158 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTR3P61158 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTR3P61158 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTR3P61158 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTR3P61158 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTR3P61158 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTR3P61158 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTR3P61158 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms