Protein–RNA interactions for Protein: P59797

SELENOV, Selenoprotein V, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOVP59797 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SELENOVP59797 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SELENOVP59797 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SELENOVP59797 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SELENOVP59797 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SELENOVP59797 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SELENOVP59797 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SELENOVP59797 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SELENOVP59797 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SELENOVP59797 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SELENOVP59797 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SELENOVP59797 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SELENOVP59797 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SELENOVP59797 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SELENOVP59797 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SELENOVP59797 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SELENOVP59797 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SELENOVP59797 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SELENOVP59797 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SELENOVP59797 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SELENOVP59797 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SELENOVP59797 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SELENOVP59797 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SELENOVP59797 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SELENOVP59797 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SELENOVP59797 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SELENOVP59797 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SELENOVP59797 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SELENOVP59797 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SELENOVP59797 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SELENOVP59797 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SELENOVP59797 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SELENOVP59797 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SELENOVP59797 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SELENOVP59797 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SELENOVP59797 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SELENOVP59797 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SELENOVP59797 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SELENOVP59797 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SELENOVP59797 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SELENOVP59797 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SELENOVP59797 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SELENOVP59797 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SELENOVP59797 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SELENOVP59797 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SELENOVP59797 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SELENOVP59797 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SELENOVP59797 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SELENOVP59797 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SELENOVP59797 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SELENOVP59797 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SELENOVP59797 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SELENOVP59797 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SELENOVP59797 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SELENOVP59797 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SELENOVP59797 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SELENOVP59797 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SELENOVP59797 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SELENOVP59797 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SELENOVP59797 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SELENOVP59797 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SELENOVP59797 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SELENOVP59797 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SELENOVP59797 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SELENOVP59797 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SELENOVP59797 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SELENOVP59797 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SELENOVP59797 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SELENOVP59797 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SELENOVP59797 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SELENOVP59797 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SELENOVP59797 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SELENOVP59797 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SELENOVP59797 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SELENOVP59797 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SELENOVP59797 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SELENOVP59797 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SELENOVP59797 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SELENOVP59797 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SELENOVP59797 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SELENOVP59797 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SELENOVP59797 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SELENOVP59797 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SELENOVP59797 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SELENOVP59797 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SELENOVP59797 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SELENOVP59797 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SELENOVP59797 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SELENOVP59797 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SELENOVP59797 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SELENOVP59797 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SELENOVP59797 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SELENOVP59797 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SELENOVP59797 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SELENOVP59797 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SELENOVP59797 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SELENOVP59797 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SELENOVP59797 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SELENOVP59797 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SELENOVP59797 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms