Protein–RNA interactions for Protein: P58304

VSX2, Visual system homeobox 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX2P58304 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VSX2P58304 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VSX2P58304 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VSX2P58304 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VSX2P58304 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VSX2P58304 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VSX2P58304 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VSX2P58304 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VSX2P58304 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VSX2P58304 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VSX2P58304 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VSX2P58304 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
VSX2P58304 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
VSX2P58304 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VSX2P58304 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
VSX2P58304 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
VSX2P58304 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
VSX2P58304 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
VSX2P58304 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
VSX2P58304 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VSX2P58304 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VSX2P58304 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VSX2P58304 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VSX2P58304 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VSX2P58304 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VSX2P58304 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VSX2P58304 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VSX2P58304 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VSX2P58304 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VSX2P58304 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VSX2P58304 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VSX2P58304 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VSX2P58304 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VSX2P58304 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VSX2P58304 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VSX2P58304 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VSX2P58304 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VSX2P58304 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VSX2P58304 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VSX2P58304 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VSX2P58304 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VSX2P58304 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VSX2P58304 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VSX2P58304 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VSX2P58304 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VSX2P58304 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VSX2P58304 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VSX2P58304 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VSX2P58304 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VSX2P58304 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VSX2P58304 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VSX2P58304 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VSX2P58304 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VSX2P58304 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VSX2P58304 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VSX2P58304 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VSX2P58304 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VSX2P58304 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VSX2P58304 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VSX2P58304 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VSX2P58304 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VSX2P58304 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
VSX2P58304 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VSX2P58304 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
VSX2P58304 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VSX2P58304 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VSX2P58304 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VSX2P58304 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VSX2P58304 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VSX2P58304 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VSX2P58304 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VSX2P58304 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
VSX2P58304 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
VSX2P58304 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VSX2P58304 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VSX2P58304 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
VSX2P58304 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VSX2P58304 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VSX2P58304 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VSX2P58304 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VSX2P58304 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VSX2P58304 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VSX2P58304 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
VSX2P58304 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VSX2P58304 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VSX2P58304 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VSX2P58304 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VSX2P58304 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VSX2P58304 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VSX2P58304 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VSX2P58304 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VSX2P58304 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VSX2P58304 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VSX2P58304 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VSX2P58304 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VSX2P58304 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VSX2P58304 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VSX2P58304 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VSX2P58304 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VSX2P58304 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.3 ms