Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TAF6P49848 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TAF6P49848 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TAF6P49848 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TAF6P49848 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TAF6P49848 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TAF6P49848 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TAF6P49848 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TAF6P49848 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TAF6P49848 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TAF6P49848 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TAF6P49848 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TAF6P49848 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TAF6P49848 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TAF6P49848 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TAF6P49848 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TAF6P49848 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TAF6P49848 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TAF6P49848 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TAF6P49848 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TAF6P49848 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TAF6P49848 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TAF6P49848 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TAF6P49848 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TAF6P49848 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TAF6P49848 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TAF6P49848 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TAF6P49848 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TAF6P49848 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TAF6P49848 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TAF6P49848 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TAF6P49848 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TAF6P49848 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TAF6P49848 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TAF6P49848 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TAF6P49848 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TAF6P49848 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TAF6P49848 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TAF6P49848 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TAF6P49848 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TAF6P49848 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TAF6P49848 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TAF6P49848 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TAF6P49848 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TAF6P49848 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TAF6P49848 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TAF6P49848 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TAF6P49848 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TAF6P49848 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TAF6P49848 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TAF6P49848 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TAF6P49848 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TAF6P49848 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TAF6P49848 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TAF6P49848 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TAF6P49848 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TAF6P49848 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TAF6P49848 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TAF6P49848 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TAF6P49848 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TAF6P49848 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TAF6P49848 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TAF6P49848 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TAF6P49848 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TAF6P49848 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TAF6P49848 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TAF6P49848 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TAF6P49848 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TAF6P49848 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TAF6P49848 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TAF6P49848 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TAF6P49848 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TAF6P49848 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TAF6P49848 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TAF6P49848 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TAF6P49848 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TAF6P49848 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TAF6P49848 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TAF6P49848 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TAF6P49848 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TAF6P49848 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TAF6P49848 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TAF6P49848 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TAF6P49848 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TAF6P49848 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TAF6P49848 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TAF6P49848 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TAF6P49848 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TAF6P49848 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TAF6P49848 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TAF6P49848 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TAF6P49848 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TAF6P49848 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TAF6P49848 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TAF6P49848 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TAF6P49848 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TAF6P49848 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TAF6P49848 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TAF6P49848 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TAF6P49848 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms