Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GSK3BP49841 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GSK3BP49841 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GSK3BP49841 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GSK3BP49841 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GSK3BP49841 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GSK3BP49841 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GSK3BP49841 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GSK3BP49841 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GSK3BP49841 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GSK3BP49841 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GSK3BP49841 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GSK3BP49841 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GSK3BP49841 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GSK3BP49841 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GSK3BP49841 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GSK3BP49841 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GSK3BP49841 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GSK3BP49841 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GSK3BP49841 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GSK3BP49841 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GSK3BP49841 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GSK3BP49841 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GSK3BP49841 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GSK3BP49841 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GSK3BP49841 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GSK3BP49841 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GSK3BP49841 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GSK3BP49841 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GSK3BP49841 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GSK3BP49841 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GSK3BP49841 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GSK3BP49841 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GSK3BP49841 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GSK3BP49841 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GSK3BP49841 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GSK3BP49841 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GSK3BP49841 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GSK3BP49841 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GSK3BP49841 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GSK3BP49841 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GSK3BP49841 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GSK3BP49841 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GSK3BP49841 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GSK3BP49841 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GSK3BP49841 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GSK3BP49841 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GSK3BP49841 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GSK3BP49841 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GSK3BP49841 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GSK3BP49841 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GSK3BP49841 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GSK3BP49841 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GSK3BP49841 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GSK3BP49841 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GSK3BP49841 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GSK3BP49841 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GSK3BP49841 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GSK3BP49841 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GSK3BP49841 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GSK3BP49841 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GSK3BP49841 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GSK3BP49841 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GSK3BP49841 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GSK3BP49841 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GSK3BP49841 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GSK3BP49841 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GSK3BP49841 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GSK3BP49841 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GSK3BP49841 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GSK3BP49841 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GSK3BP49841 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GSK3BP49841 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GSK3BP49841 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GSK3BP49841 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GSK3BP49841 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GSK3BP49841 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GSK3BP49841 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GSK3BP49841 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GSK3BP49841 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GSK3BP49841 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GSK3BP49841 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GSK3BP49841 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GSK3BP49841 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GSK3BP49841 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GSK3BP49841 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GSK3BP49841 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GSK3BP49841 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GSK3BP49841 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GSK3BP49841 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GSK3BP49841 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GSK3BP49841 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GSK3BP49841 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GSK3BP49841 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GSK3BP49841 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GSK3BP49841 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GSK3BP49841 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GSK3BP49841 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GSK3BP49841 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GSK3BP49841 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.9 ms