Protein–RNA interactions for Protein: P49721

PSMB2, Proteasome subunit beta type-2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB2P49721 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB2P49721 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB2P49721 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB2P49721 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB2P49721 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB2P49721 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB2P49721 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB2P49721 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB2P49721 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB2P49721 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB2P49721 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB2P49721 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB2P49721 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB2P49721 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB2P49721 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB2P49721 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB2P49721 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB2P49721 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB2P49721 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB2P49721 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB2P49721 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB2P49721 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB2P49721 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB2P49721 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB2P49721 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB2P49721 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB2P49721 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB2P49721 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB2P49721 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB2P49721 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB2P49721 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB2P49721 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB2P49721 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB2P49721 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB2P49721 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB2P49721 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB2P49721 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB2P49721 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB2P49721 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB2P49721 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB2P49721 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB2P49721 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB2P49721 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB2P49721 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB2P49721 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB2P49721 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB2P49721 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB2P49721 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB2P49721 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB2P49721 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB2P49721 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB2P49721 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB2P49721 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PSMB2P49721 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PSMB2P49721 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB2P49721 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB2P49721 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB2P49721 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB2P49721 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB2P49721 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB2P49721 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB2P49721 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB2P49721 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB2P49721 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB2P49721 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB2P49721 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB2P49721 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB2P49721 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB2P49721 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB2P49721 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB2P49721 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB2P49721 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB2P49721 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB2P49721 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB2P49721 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB2P49721 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB2P49721 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB2P49721 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB2P49721 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB2P49721 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB2P49721 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB2P49721 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB2P49721 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB2P49721 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB2P49721 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB2P49721 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB2P49721 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB2P49721 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB2P49721 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB2P49721 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB2P49721 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB2P49721 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB2P49721 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB2P49721 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB2P49721 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB2P49721 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB2P49721 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB2P49721 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB2P49721 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB2P49721 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms