Protein–RNA interactions for Protein: P48547

KCNC1, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 1, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC1P48547 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNC1P48547 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNC1P48547 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNC1P48547 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNC1P48547 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNC1P48547 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNC1P48547 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNC1P48547 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNC1P48547 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNC1P48547 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNC1P48547 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNC1P48547 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNC1P48547 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNC1P48547 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNC1P48547 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNC1P48547 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNC1P48547 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNC1P48547 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNC1P48547 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNC1P48547 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNC1P48547 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNC1P48547 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNC1P48547 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNC1P48547 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNC1P48547 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNC1P48547 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNC1P48547 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNC1P48547 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNC1P48547 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNC1P48547 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNC1P48547 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KCNC1P48547 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KCNC1P48547 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
KCNC1P48547 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNC1P48547 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNC1P48547 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNC1P48547 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNC1P48547 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNC1P48547 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNC1P48547 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNC1P48547 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNC1P48547 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNC1P48547 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNC1P48547 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNC1P48547 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNC1P48547 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNC1P48547 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNC1P48547 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNC1P48547 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNC1P48547 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNC1P48547 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNC1P48547 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNC1P48547 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNC1P48547 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNC1P48547 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNC1P48547 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNC1P48547 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNC1P48547 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNC1P48547 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNC1P48547 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNC1P48547 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNC1P48547 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNC1P48547 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNC1P48547 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNC1P48547 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNC1P48547 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNC1P48547 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNC1P48547 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNC1P48547 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNC1P48547 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNC1P48547 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNC1P48547 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNC1P48547 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNC1P48547 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNC1P48547 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNC1P48547 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNC1P48547 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNC1P48547 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNC1P48547 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNC1P48547 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNC1P48547 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNC1P48547 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNC1P48547 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNC1P48547 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNC1P48547 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNC1P48547 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNC1P48547 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KCNC1P48547 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KCNC1P48547 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KCNC1P48547 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNC1P48547 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNC1P48547 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNC1P48547 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNC1P48547 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNC1P48547 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNC1P48547 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNC1P48547 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNC1P48547 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNC1P48547 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNC1P48547 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms