Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ME1P48163 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
ME1P48163 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ME1P48163 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ME1P48163 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ME1P48163 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ME1P48163 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ME1P48163 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ME1P48163 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ME1P48163 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ME1P48163 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ME1P48163 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ME1P48163 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ME1P48163 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ME1P48163 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ME1P48163 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ME1P48163 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ME1P48163 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ME1P48163 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ME1P48163 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ME1P48163 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ME1P48163 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ME1P48163 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ME1P48163 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ME1P48163 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ME1P48163 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ME1P48163 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ME1P48163 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ME1P48163 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ME1P48163 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ME1P48163 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ME1P48163 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ME1P48163 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ME1P48163 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ME1P48163 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ME1P48163 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ME1P48163 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
ME1P48163 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ME1P48163 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ME1P48163 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ME1P48163 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ME1P48163 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ME1P48163 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ME1P48163 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ME1P48163 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ME1P48163 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ME1P48163 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ME1P48163 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
ME1P48163 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
ME1P48163 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ME1P48163 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ME1P48163 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ME1P48163 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ME1P48163 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ME1P48163 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ME1P48163 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ME1P48163 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ME1P48163 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ME1P48163 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ME1P48163 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ME1P48163 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ME1P48163 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ME1P48163 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ME1P48163 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
ME1P48163 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ME1P48163 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ME1P48163 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ME1P48163 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ME1P48163 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ME1P48163 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ME1P48163 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ME1P48163 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ME1P48163 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ME1P48163 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ME1P48163 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ME1P48163 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ME1P48163 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ME1P48163 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ME1P48163 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ME1P48163 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ME1P48163 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
ME1P48163 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ME1P48163 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ME1P48163 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ME1P48163 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
ME1P48163 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
ME1P48163 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ME1P48163 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ME1P48163 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ME1P48163 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ME1P48163 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ME1P48163 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ME1P48163 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ME1P48163 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ME1P48163 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ME1P48163 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ME1P48163 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ME1P48163 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ME1P48163 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ME1P48163 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms