Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GNPDA1P46926 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GNPDA1P46926 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GNPDA1P46926 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GNPDA1P46926 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GNPDA1P46926 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GNPDA1P46926 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GNPDA1P46926 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GNPDA1P46926 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GNPDA1P46926 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GNPDA1P46926 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GNPDA1P46926 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GNPDA1P46926 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GNPDA1P46926 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GNPDA1P46926 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GNPDA1P46926 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GNPDA1P46926 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GNPDA1P46926 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GNPDA1P46926 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GNPDA1P46926 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GNPDA1P46926 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GNPDA1P46926 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GNPDA1P46926 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GNPDA1P46926 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GNPDA1P46926 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GNPDA1P46926 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GNPDA1P46926 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GNPDA1P46926 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GNPDA1P46926 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GNPDA1P46926 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GNPDA1P46926 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GNPDA1P46926 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GNPDA1P46926 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GNPDA1P46926 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GNPDA1P46926 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GNPDA1P46926 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GNPDA1P46926 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GNPDA1P46926 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GNPDA1P46926 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GNPDA1P46926 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GNPDA1P46926 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GNPDA1P46926 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GNPDA1P46926 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GNPDA1P46926 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GNPDA1P46926 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GNPDA1P46926 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GNPDA1P46926 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GNPDA1P46926 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GNPDA1P46926 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GNPDA1P46926 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GNPDA1P46926 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GNPDA1P46926 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GNPDA1P46926 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GNPDA1P46926 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GNPDA1P46926 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GNPDA1P46926 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GNPDA1P46926 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GNPDA1P46926 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GNPDA1P46926 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GNPDA1P46926 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GNPDA1P46926 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GNPDA1P46926 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GNPDA1P46926 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GNPDA1P46926 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GNPDA1P46926 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GNPDA1P46926 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GNPDA1P46926 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GNPDA1P46926 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GNPDA1P46926 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GNPDA1P46926 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GNPDA1P46926 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GNPDA1P46926 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GNPDA1P46926 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GNPDA1P46926 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GNPDA1P46926 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GNPDA1P46926 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GNPDA1P46926 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GNPDA1P46926 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GNPDA1P46926 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GNPDA1P46926 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GNPDA1P46926 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GNPDA1P46926 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GNPDA1P46926 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GNPDA1P46926 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GNPDA1P46926 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GNPDA1P46926 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GNPDA1P46926 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GNPDA1P46926 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GNPDA1P46926 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GNPDA1P46926 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GNPDA1P46926 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GNPDA1P46926 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GNPDA1P46926 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GNPDA1P46926 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GNPDA1P46926 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GNPDA1P46926 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GNPDA1P46926 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GNPDA1P46926 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GNPDA1P46926 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GNPDA1P46926 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms