Protein–RNA interactions for Protein: P43235

CTSK, Cathepsin K, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSKP43235 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CTSKP43235 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTSKP43235 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTSKP43235 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTSKP43235 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTSKP43235 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTSKP43235 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTSKP43235 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTSKP43235 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTSKP43235 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTSKP43235 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTSKP43235 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTSKP43235 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTSKP43235 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTSKP43235 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTSKP43235 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTSKP43235 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTSKP43235 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTSKP43235 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTSKP43235 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTSKP43235 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTSKP43235 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTSKP43235 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTSKP43235 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTSKP43235 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTSKP43235 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTSKP43235 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTSKP43235 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTSKP43235 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTSKP43235 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTSKP43235 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTSKP43235 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTSKP43235 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTSKP43235 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTSKP43235 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTSKP43235 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTSKP43235 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTSKP43235 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTSKP43235 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTSKP43235 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTSKP43235 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTSKP43235 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTSKP43235 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTSKP43235 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTSKP43235 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTSKP43235 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTSKP43235 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTSKP43235 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTSKP43235 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTSKP43235 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTSKP43235 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTSKP43235 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTSKP43235 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTSKP43235 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CTSKP43235 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTSKP43235 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CTSKP43235 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTSKP43235 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTSKP43235 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTSKP43235 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTSKP43235 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTSKP43235 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTSKP43235 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CTSKP43235 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTSKP43235 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTSKP43235 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTSKP43235 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTSKP43235 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTSKP43235 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTSKP43235 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTSKP43235 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTSKP43235 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CTSKP43235 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTSKP43235 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTSKP43235 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTSKP43235 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTSKP43235 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTSKP43235 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTSKP43235 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTSKP43235 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTSKP43235 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTSKP43235 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTSKP43235 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTSKP43235 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTSKP43235 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTSKP43235 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CTSKP43235 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTSKP43235 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTSKP43235 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTSKP43235 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTSKP43235 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTSKP43235 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTSKP43235 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTSKP43235 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTSKP43235 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTSKP43235 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CTSKP43235 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTSKP43235 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTSKP43235 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTSKP43235 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms