Protein–RNA interactions for Protein: P43088

PTGFR, Prostaglandin F2-alpha receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRP43088 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTGFRP43088 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTGFRP43088 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTGFRP43088 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTGFRP43088 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTGFRP43088 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTGFRP43088 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTGFRP43088 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTGFRP43088 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTGFRP43088 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTGFRP43088 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTGFRP43088 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTGFRP43088 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTGFRP43088 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTGFRP43088 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTGFRP43088 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTGFRP43088 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTGFRP43088 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTGFRP43088 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTGFRP43088 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTGFRP43088 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTGFRP43088 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTGFRP43088 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTGFRP43088 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTGFRP43088 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTGFRP43088 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PTGFRP43088 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTGFRP43088 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PTGFRP43088 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTGFRP43088 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTGFRP43088 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTGFRP43088 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTGFRP43088 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PTGFRP43088 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTGFRP43088 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTGFRP43088 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTGFRP43088 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTGFRP43088 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGFRP43088 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGFRP43088 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGFRP43088 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGFRP43088 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGFRP43088 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGFRP43088 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGFRP43088 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGFRP43088 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGFRP43088 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGFRP43088 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGFRP43088 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGFRP43088 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGFRP43088 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGFRP43088 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGFRP43088 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGFRP43088 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGFRP43088 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGFRP43088 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGFRP43088 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGFRP43088 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGFRP43088 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGFRP43088 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGFRP43088 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGFRP43088 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGFRP43088 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGFRP43088 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGFRP43088 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGFRP43088 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGFRP43088 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGFRP43088 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGFRP43088 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGFRP43088 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGFRP43088 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGFRP43088 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGFRP43088 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGFRP43088 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGFRP43088 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGFRP43088 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGFRP43088 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGFRP43088 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGFRP43088 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGFRP43088 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGFRP43088 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTGFRP43088 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTGFRP43088 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTGFRP43088 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTGFRP43088 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTGFRP43088 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTGFRP43088 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTGFRP43088 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTGFRP43088 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTGFRP43088 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTGFRP43088 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTGFRP43088 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTGFRP43088 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTGFRP43088 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTGFRP43088 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTGFRP43088 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTGFRP43088 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTGFRP43088 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTGFRP43088 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTGFRP43088 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms