Protein–RNA interactions for Protein: P40937

RFC5, Replication factor C subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC5P40937 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
RFC5P40937 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RFC5P40937 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RFC5P40937 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RFC5P40937 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RFC5P40937 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RFC5P40937 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RFC5P40937 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
RFC5P40937 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RFC5P40937 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RFC5P40937 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RFC5P40937 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RFC5P40937 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RFC5P40937 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RFC5P40937 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RFC5P40937 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RFC5P40937 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RFC5P40937 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RFC5P40937 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RFC5P40937 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RFC5P40937 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RFC5P40937 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RFC5P40937 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RFC5P40937 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RFC5P40937 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RFC5P40937 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RFC5P40937 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RFC5P40937 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RFC5P40937 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RFC5P40937 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RFC5P40937 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RFC5P40937 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RFC5P40937 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RFC5P40937 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RFC5P40937 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RFC5P40937 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RFC5P40937 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RFC5P40937 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RFC5P40937 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RFC5P40937 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RFC5P40937 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RFC5P40937 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RFC5P40937 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
RFC5P40937 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RFC5P40937 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RFC5P40937 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RFC5P40937 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RFC5P40937 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RFC5P40937 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RFC5P40937 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RFC5P40937 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RFC5P40937 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RFC5P40937 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RFC5P40937 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RFC5P40937 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RFC5P40937 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RFC5P40937 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RFC5P40937 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RFC5P40937 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RFC5P40937 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RFC5P40937 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RFC5P40937 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RFC5P40937 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
RFC5P40937 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RFC5P40937 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RFC5P40937 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RFC5P40937 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RFC5P40937 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RFC5P40937 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
RFC5P40937 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RFC5P40937 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RFC5P40937 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RFC5P40937 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
RFC5P40937 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RFC5P40937 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
RFC5P40937 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RFC5P40937 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RFC5P40937 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RFC5P40937 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RFC5P40937 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RFC5P40937 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RFC5P40937 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RFC5P40937 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
RFC5P40937 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RFC5P40937 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RFC5P40937 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RFC5P40937 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RFC5P40937 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RFC5P40937 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RFC5P40937 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RFC5P40937 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RFC5P40937 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RFC5P40937 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RFC5P40937 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RFC5P40937 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RFC5P40937 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RFC5P40937 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
RFC5P40937 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RFC5P40937 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RFC5P40937 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms