Protein–RNA interactions for Protein: P35680

HNF1B, Hepatocyte nuclear factor 1-beta, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF1BP35680 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HNF1BP35680 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
HNF1BP35680 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HNF1BP35680 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HNF1BP35680 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HNF1BP35680 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HNF1BP35680 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HNF1BP35680 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HNF1BP35680 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HNF1BP35680 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HNF1BP35680 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HNF1BP35680 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HNF1BP35680 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HNF1BP35680 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HNF1BP35680 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HNF1BP35680 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HNF1BP35680 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HNF1BP35680 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HNF1BP35680 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HNF1BP35680 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HNF1BP35680 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HNF1BP35680 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HNF1BP35680 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HNF1BP35680 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HNF1BP35680 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HNF1BP35680 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HNF1BP35680 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HNF1BP35680 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HNF1BP35680 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HNF1BP35680 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HNF1BP35680 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HNF1BP35680 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HNF1BP35680 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HNF1BP35680 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HNF1BP35680 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HNF1BP35680 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
HNF1BP35680 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HNF1BP35680 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HNF1BP35680 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HNF1BP35680 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HNF1BP35680 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HNF1BP35680 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HNF1BP35680 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HNF1BP35680 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HNF1BP35680 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HNF1BP35680 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HNF1BP35680 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
HNF1BP35680 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HNF1BP35680 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HNF1BP35680 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HNF1BP35680 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HNF1BP35680 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HNF1BP35680 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
HNF1BP35680 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HNF1BP35680 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HNF1BP35680 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HNF1BP35680 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
HNF1BP35680 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HNF1BP35680 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HNF1BP35680 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HNF1BP35680 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HNF1BP35680 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HNF1BP35680 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HNF1BP35680 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HNF1BP35680 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HNF1BP35680 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HNF1BP35680 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HNF1BP35680 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HNF1BP35680 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HNF1BP35680 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HNF1BP35680 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HNF1BP35680 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HNF1BP35680 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HNF1BP35680 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HNF1BP35680 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HNF1BP35680 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HNF1BP35680 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HNF1BP35680 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HNF1BP35680 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HNF1BP35680 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HNF1BP35680 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HNF1BP35680 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HNF1BP35680 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HNF1BP35680 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HNF1BP35680 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HNF1BP35680 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HNF1BP35680 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HNF1BP35680 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HNF1BP35680 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HNF1BP35680 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HNF1BP35680 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HNF1BP35680 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HNF1BP35680 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HNF1BP35680 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HNF1BP35680 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HNF1BP35680 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HNF1BP35680 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HNF1BP35680 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HNF1BP35680 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HNF1BP35680 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 234.4 ms