Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTNNA1P35221 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTNNA1P35221 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTNNA1P35221 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTNNA1P35221 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTNNA1P35221 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CTNNA1P35221 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTNNA1P35221 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTNNA1P35221 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTNNA1P35221 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTNNA1P35221 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTNNA1P35221 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTNNA1P35221 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTNNA1P35221 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTNNA1P35221 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTNNA1P35221 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTNNA1P35221 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CTNNA1P35221 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CTNNA1P35221 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTNNA1P35221 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTNNA1P35221 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTNNA1P35221 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTNNA1P35221 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTNNA1P35221 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTNNA1P35221 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTNNA1P35221 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTNNA1P35221 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTNNA1P35221 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTNNA1P35221 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTNNA1P35221 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTNNA1P35221 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTNNA1P35221 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTNNA1P35221 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTNNA1P35221 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CTNNA1P35221 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTNNA1P35221 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTNNA1P35221 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CTNNA1P35221 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTNNA1P35221 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTNNA1P35221 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTNNA1P35221 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTNNA1P35221 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTNNA1P35221 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTNNA1P35221 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTNNA1P35221 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTNNA1P35221 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CTNNA1P35221 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTNNA1P35221 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTNNA1P35221 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTNNA1P35221 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTNNA1P35221 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTNNA1P35221 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTNNA1P35221 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTNNA1P35221 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTNNA1P35221 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTNNA1P35221 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTNNA1P35221 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTNNA1P35221 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTNNA1P35221 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTNNA1P35221 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTNNA1P35221 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTNNA1P35221 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTNNA1P35221 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTNNA1P35221 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTNNA1P35221 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTNNA1P35221 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTNNA1P35221 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTNNA1P35221 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTNNA1P35221 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTNNA1P35221 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CTNNA1P35221 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTNNA1P35221 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CTNNA1P35221 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTNNA1P35221 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTNNA1P35221 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTNNA1P35221 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTNNA1P35221 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTNNA1P35221 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTNNA1P35221 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTNNA1P35221 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTNNA1P35221 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTNNA1P35221 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTNNA1P35221 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTNNA1P35221 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTNNA1P35221 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTNNA1P35221 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTNNA1P35221 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CTNNA1P35221 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTNNA1P35221 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTNNA1P35221 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTNNA1P35221 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTNNA1P35221 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTNNA1P35221 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTNNA1P35221 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTNNA1P35221 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CTNNA1P35221 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTNNA1P35221 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTNNA1P35221 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTNNA1P35221 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTNNA1P35221 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms