Protein–RNA interactions for Protein: P33947

KDELR2, ER lumen protein-retaining receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR2P33947 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KDELR2P33947 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KDELR2P33947 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KDELR2P33947 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KDELR2P33947 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KDELR2P33947 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KDELR2P33947 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KDELR2P33947 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KDELR2P33947 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KDELR2P33947 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KDELR2P33947 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KDELR2P33947 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KDELR2P33947 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KDELR2P33947 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KDELR2P33947 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KDELR2P33947 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KDELR2P33947 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
KDELR2P33947 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDELR2P33947 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDELR2P33947 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDELR2P33947 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDELR2P33947 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDELR2P33947 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDELR2P33947 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDELR2P33947 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDELR2P33947 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDELR2P33947 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KDELR2P33947 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
KDELR2P33947 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KDELR2P33947 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDELR2P33947 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KDELR2P33947 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDELR2P33947 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
KDELR2P33947 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDELR2P33947 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDELR2P33947 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDELR2P33947 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDELR2P33947 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDELR2P33947 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDELR2P33947 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDELR2P33947 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDELR2P33947 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDELR2P33947 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDELR2P33947 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDELR2P33947 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDELR2P33947 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDELR2P33947 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDELR2P33947 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDELR2P33947 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDELR2P33947 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KDELR2P33947 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDELR2P33947 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDELR2P33947 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
KDELR2P33947 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDELR2P33947 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
KDELR2P33947 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDELR2P33947 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
KDELR2P33947 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDELR2P33947 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDELR2P33947 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDELR2P33947 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
KDELR2P33947 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDELR2P33947 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDELR2P33947 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDELR2P33947 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KDELR2P33947 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KDELR2P33947 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KDELR2P33947 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KDELR2P33947 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KDELR2P33947 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KDELR2P33947 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KDELR2P33947 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KDELR2P33947 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KDELR2P33947 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KDELR2P33947 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KDELR2P33947 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KDELR2P33947 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KDELR2P33947 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KDELR2P33947 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KDELR2P33947 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KDELR2P33947 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KDELR2P33947 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KDELR2P33947 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KDELR2P33947 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KDELR2P33947 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KDELR2P33947 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KDELR2P33947 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KDELR2P33947 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KDELR2P33947 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KDELR2P33947 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KDELR2P33947 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KDELR2P33947 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KDELR2P33947 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KDELR2P33947 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KDELR2P33947 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KDELR2P33947 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KDELR2P33947 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
KDELR2P33947 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KDELR2P33947 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KDELR2P33947 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms