Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
OTX2P32243 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OTX2P32243 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OTX2P32243 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OTX2P32243 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OTX2P32243 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OTX2P32243 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
OTX2P32243 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
OTX2P32243 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OTX2P32243 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OTX2P32243 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTX2P32243 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTX2P32243 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTX2P32243 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTX2P32243 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTX2P32243 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTX2P32243 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTX2P32243 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTX2P32243 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
OTX2P32243 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
OTX2P32243 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
OTX2P32243 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
OTX2P32243 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
OTX2P32243 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
OTX2P32243 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
OTX2P32243 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
OTX2P32243 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
OTX2P32243 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
OTX2P32243 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
OTX2P32243 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTX2P32243 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTX2P32243 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTX2P32243 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTX2P32243 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTX2P32243 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTX2P32243 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTX2P32243 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTX2P32243 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
OTX2P32243 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTX2P32243 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTX2P32243 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTX2P32243 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTX2P32243 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
OTX2P32243 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OTX2P32243 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OTX2P32243 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
OTX2P32243 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OTX2P32243 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
OTX2P32243 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OTX2P32243 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTX2P32243 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTX2P32243 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTX2P32243 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTX2P32243 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTX2P32243 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTX2P32243 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTX2P32243 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
OTX2P32243 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
OTX2P32243 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
OTX2P32243 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
OTX2P32243 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
OTX2P32243 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
OTX2P32243 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
OTX2P32243 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OTX2P32243 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OTX2P32243 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OTX2P32243 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OTX2P32243 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OTX2P32243 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
OTX2P32243 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
OTX2P32243 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
OTX2P32243 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OTX2P32243 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OTX2P32243 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
OTX2P32243 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
OTX2P32243 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
OTX2P32243 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OTX2P32243 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
OTX2P32243 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
OTX2P32243 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
OTX2P32243 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
OTX2P32243 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OTX2P32243 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
OTX2P32243 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
OTX2P32243 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
OTX2P32243 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OTX2P32243 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
OTX2P32243 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OTX2P32243 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
OTX2P32243 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
OTX2P32243 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
OTX2P32243 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
OTX2P32243 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OTX2P32243 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
OTX2P32243 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OTX2P32243 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
OTX2P32243 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
OTX2P32243 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
OTX2P32243 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
OTX2P32243 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.8 ms