Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CPS1P31327 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
CPS1P31327 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
CPS1P31327 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CPS1P31327 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
CPS1P31327 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CPS1P31327 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CPS1P31327 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CPS1P31327 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CPS1P31327 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CPS1P31327 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CPS1P31327 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
CPS1P31327 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
CPS1P31327 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
CPS1P31327 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
CPS1P31327 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CPS1P31327 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC34■■■■□ 3.03
CPS1P31327 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
CPS1P31327 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CPS1P31327 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC34■■■■□ 3.03
CPS1P31327 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CPS1P31327 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CPS1P31327 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CPS1P31327 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CPS1P31327 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CPS1P31327 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CPS1P31327 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CPS1P31327 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
CPS1P31327 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CPS1P31327 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CPS1P31327 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CPS1P31327 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CPS1P31327 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CPS1P31327 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CPS1P31327 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CPS1P31327 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CPS1P31327 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CPS1P31327 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
CPS1P31327 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CPS1P31327 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CPS1P31327 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CPS1P31327 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CPS1P31327 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CPS1P31327 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CPS1P31327 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CPS1P31327 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
CPS1P31327 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
CPS1P31327 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
CPS1P31327 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
CPS1P31327 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CPS1P31327 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
CPS1P31327 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
CPS1P31327 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CPS1P31327 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CPS1P31327 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CPS1P31327 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CPS1P31327 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CPS1P31327 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CPS1P31327 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CPS1P31327 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CPS1P31327 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CPS1P31327 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CPS1P31327 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CPS1P31327 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CPS1P31327 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CPS1P31327 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CPS1P31327 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CPS1P31327 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CPS1P31327 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CPS1P31327 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CPS1P31327 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
CPS1P31327 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CPS1P31327 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CPS1P31327 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CPS1P31327 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CPS1P31327 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CPS1P31327 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CPS1P31327 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CPS1P31327 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CPS1P31327 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CPS1P31327 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CPS1P31327 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CPS1P31327 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CPS1P31327 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CPS1P31327 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CPS1P31327 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CPS1P31327 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
CPS1P31327 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CPS1P31327 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CPS1P31327 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CPS1P31327 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
CPS1P31327 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CPS1P31327 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CPS1P31327 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CPS1P31327 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CPS1P31327 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CPS1P31327 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CPS1P31327 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CPS1P31327 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CPS1P31327 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms