Protein–RNA interactions for Protein: P30532

CHRNA5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA5P30532 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CHRNA5P30532 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CHRNA5P30532 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CHRNA5P30532 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CHRNA5P30532 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CHRNA5P30532 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CHRNA5P30532 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CHRNA5P30532 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CHRNA5P30532 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CHRNA5P30532 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CHRNA5P30532 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
CHRNA5P30532 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
CHRNA5P30532 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CHRNA5P30532 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CHRNA5P30532 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CHRNA5P30532 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CHRNA5P30532 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CHRNA5P30532 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CHRNA5P30532 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CHRNA5P30532 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CHRNA5P30532 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CHRNA5P30532 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CHRNA5P30532 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CHRNA5P30532 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CHRNA5P30532 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CHRNA5P30532 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CHRNA5P30532 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CHRNA5P30532 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CHRNA5P30532 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CHRNA5P30532 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CHRNA5P30532 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CHRNA5P30532 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CHRNA5P30532 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CHRNA5P30532 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CHRNA5P30532 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
CHRNA5P30532 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CHRNA5P30532 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
CHRNA5P30532 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CHRNA5P30532 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CHRNA5P30532 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CHRNA5P30532 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CHRNA5P30532 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CHRNA5P30532 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CHRNA5P30532 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CHRNA5P30532 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CHRNA5P30532 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CHRNA5P30532 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CHRNA5P30532 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CHRNA5P30532 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CHRNA5P30532 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CHRNA5P30532 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CHRNA5P30532 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
CHRNA5P30532 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CHRNA5P30532 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CHRNA5P30532 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CHRNA5P30532 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CHRNA5P30532 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CHRNA5P30532 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CHRNA5P30532 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CHRNA5P30532 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CHRNA5P30532 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CHRNA5P30532 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CHRNA5P30532 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CHRNA5P30532 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CHRNA5P30532 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CHRNA5P30532 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CHRNA5P30532 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CHRNA5P30532 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CHRNA5P30532 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CHRNA5P30532 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CHRNA5P30532 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
CHRNA5P30532 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CHRNA5P30532 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
CHRNA5P30532 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CHRNA5P30532 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CHRNA5P30532 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
CHRNA5P30532 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CHRNA5P30532 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CHRNA5P30532 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CHRNA5P30532 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
CHRNA5P30532 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CHRNA5P30532 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CHRNA5P30532 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CHRNA5P30532 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CHRNA5P30532 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
CHRNA5P30532 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CHRNA5P30532 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CHRNA5P30532 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CHRNA5P30532 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CHRNA5P30532 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CHRNA5P30532 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CHRNA5P30532 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
CHRNA5P30532 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
CHRNA5P30532 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CHRNA5P30532 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CHRNA5P30532 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CHRNA5P30532 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CHRNA5P30532 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CHRNA5P30532 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CHRNA5P30532 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms