Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
LMOD1P29536 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LMOD1P29536 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LMOD1P29536 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LMOD1P29536 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LMOD1P29536 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LMOD1P29536 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
LMOD1P29536 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LMOD1P29536 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LMOD1P29536 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LMOD1P29536 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LMOD1P29536 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LMOD1P29536 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LMOD1P29536 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LMOD1P29536 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LMOD1P29536 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
LMOD1P29536 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
LMOD1P29536 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LMOD1P29536 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LMOD1P29536 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LMOD1P29536 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LMOD1P29536 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LMOD1P29536 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LMOD1P29536 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LMOD1P29536 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LMOD1P29536 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LMOD1P29536 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LMOD1P29536 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LMOD1P29536 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
LMOD1P29536 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
LMOD1P29536 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LMOD1P29536 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LMOD1P29536 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LMOD1P29536 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LMOD1P29536 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LMOD1P29536 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LMOD1P29536 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LMOD1P29536 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LMOD1P29536 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LMOD1P29536 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LMOD1P29536 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LMOD1P29536 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LMOD1P29536 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LMOD1P29536 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LMOD1P29536 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LMOD1P29536 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LMOD1P29536 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
LMOD1P29536 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LMOD1P29536 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LMOD1P29536 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LMOD1P29536 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LMOD1P29536 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LMOD1P29536 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LMOD1P29536 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
LMOD1P29536 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
LMOD1P29536 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LMOD1P29536 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LMOD1P29536 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LMOD1P29536 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LMOD1P29536 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LMOD1P29536 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LMOD1P29536 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
LMOD1P29536 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LMOD1P29536 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LMOD1P29536 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LMOD1P29536 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LMOD1P29536 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LMOD1P29536 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
LMOD1P29536 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LMOD1P29536 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LMOD1P29536 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LMOD1P29536 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LMOD1P29536 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LMOD1P29536 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LMOD1P29536 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LMOD1P29536 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LMOD1P29536 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LMOD1P29536 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LMOD1P29536 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LMOD1P29536 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LMOD1P29536 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LMOD1P29536 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LMOD1P29536 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LMOD1P29536 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LMOD1P29536 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LMOD1P29536 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LMOD1P29536 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LMOD1P29536 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LMOD1P29536 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
LMOD1P29536 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LMOD1P29536 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
LMOD1P29536 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LMOD1P29536 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LMOD1P29536 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LMOD1P29536 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LMOD1P29536 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LMOD1P29536 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LMOD1P29536 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
LMOD1P29536 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
LMOD1P29536 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms