Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
POLD1P28340 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
POLD1P28340 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
POLD1P28340 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
POLD1P28340 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
POLD1P28340 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
POLD1P28340 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
POLD1P28340 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC30■■■□□ 2.39
POLD1P28340 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC30■■■□□ 2.39
POLD1P28340 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
POLD1P28340 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
POLD1P28340 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC30■■■□□ 2.39
POLD1P28340 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
POLD1P28340 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
POLD1P28340 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
POLD1P28340 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
POLD1P28340 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
POLD1P28340 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
POLD1P28340 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
POLD1P28340 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
POLD1P28340 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
POLD1P28340 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
POLD1P28340 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
POLD1P28340 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
POLD1P28340 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
POLD1P28340 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
POLD1P28340 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
POLD1P28340 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
POLD1P28340 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
POLD1P28340 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
POLD1P28340 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
POLD1P28340 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
POLD1P28340 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
POLD1P28340 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
POLD1P28340 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
POLD1P28340 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
POLD1P28340 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
POLD1P28340 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
POLD1P28340 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
POLD1P28340 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
POLD1P28340 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
POLD1P28340 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
POLD1P28340 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
POLD1P28340 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
POLD1P28340 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
POLD1P28340 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
POLD1P28340 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
POLD1P28340 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
POLD1P28340 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
POLD1P28340 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
POLD1P28340 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
POLD1P28340 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
POLD1P28340 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
POLD1P28340 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
POLD1P28340 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
POLD1P28340 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
POLD1P28340 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
POLD1P28340 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
POLD1P28340 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
POLD1P28340 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
POLD1P28340 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
POLD1P28340 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
POLD1P28340 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
POLD1P28340 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
POLD1P28340 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
POLD1P28340 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
POLD1P28340 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
POLD1P28340 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
POLD1P28340 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
POLD1P28340 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
POLD1P28340 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
POLD1P28340 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
POLD1P28340 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
POLD1P28340 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
POLD1P28340 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
POLD1P28340 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
POLD1P28340 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
POLD1P28340 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
POLD1P28340 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
POLD1P28340 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
POLD1P28340 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
POLD1P28340 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
POLD1P28340 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
POLD1P28340 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
POLD1P28340 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
POLD1P28340 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
POLD1P28340 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
POLD1P28340 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
POLD1P28340 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
POLD1P28340 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
POLD1P28340 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
POLD1P28340 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC29.82■■■□□ 2.36
POLD1P28340 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
POLD1P28340 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
POLD1P28340 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
POLD1P28340 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
POLD1P28340 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
POLD1P28340 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
POLD1P28340 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
POLD1P28340 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.4 ms